37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2328 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2328  membrane protein-like protein  100 
 
 
188 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529679  normal  0.28675 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1693  membrane protein-like  98.94 
 
 
188 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2305  membrane protein-like protein  98.94 
 
 
188 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5647  membrane protein-like  92.55 
 
 
189 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0973  membrane protein-like protein  91.44 
 
 
189 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2224  membrane protein-like protein  88.3 
 
 
188 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566223  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2344  membrane protein-like protein  88.3 
 
 
188 aa  346  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1365  hypothetical protein  75.27 
 
 
272 aa  280  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1903  hypothetical protein  75.27 
 
 
269 aa  280  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.515369  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1207  hypothetical protein  74.46 
 
 
197 aa  280  9e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0336  hypothetical protein  74.46 
 
 
197 aa  280  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1215  hypothetical protein  74.46 
 
 
197 aa  280  9e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312554  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0815  hypothetical protein  74.46 
 
 
197 aa  280  9e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1053  hypothetical protein  74.46 
 
 
197 aa  280  9e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0993  hypothetical protein  76.35 
 
 
149 aa  228  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.27853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1157  hypothetical protein  63.54 
 
 
238 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.596662  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5449  hypothetical protein  62.29 
 
 
189 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.962565 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1017  hypothetical protein  39.77 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0765  hypothetical protein  40 
 
 
217 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.644467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1329  hypothetical protein  37.35 
 
 
217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666788  normal  0.253277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1474  hypothetical protein  38.52 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1312  hypothetical protein  38.52 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12921  hypothetical protein  28.87 
 
 
151 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0893341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1134  hypothetical protein  29.75 
 
 
376 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4805  hypothetical protein  28.72 
 
 
379 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337418  normal  0.112306 
 
 
-
 
NC_004310  BR1809  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1742  hypothetical protein  32.43 
 
 
176 aa  51.6  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.62552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1914  protein of unknown function DUF939  27.69 
 
 
395 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7105  hypothetical protein  30.08 
 
 
350 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  33.83 
 
 
361 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2884  hypothetical protein  25.76 
 
 
360 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0097  hypothetical protein  28.03 
 
 
347 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0146368  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0015  hypothetical protein  27.27 
 
 
380 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2736  hypothetical protein  29.94 
 
 
363 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30564  normal  0.0867479 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1953  hypothetical protein  23.21 
 
 
364 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1919  hypothetical protein  23.21 
 
 
364 aa  42  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1280  hypothetical protein  27.4 
 
 
364 aa  41.6  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.638215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>