71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3379 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3379  Beta-lactamase  100 
 
 
320 aa  657  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4788  Beta-lactamase  99.63 
 
 
270 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.802032  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4137  Beta-lactamase  99.63 
 
 
270 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2849  Beta-lactamase  81.04 
 
 
269 aa  454  1e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_003296  RS02005  oxacillin hydrolase  58.3 
 
 
272 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4544  Beta-lactamase  62.24 
 
 
266 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.487352  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3817  Beta-lactamase  55.2 
 
 
275 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3930  Beta-lactamase  55.2 
 
 
275 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.204659 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0373  beta-lactamase precursor  51.12 
 
 
269 aa  281  7e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.313009  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2872  class D beta-lactamase  51.3 
 
 
269 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314604  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1106  class D beta-lactamase  50.93 
 
 
473 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.56971  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2719  class D beta-lactamase  51.3 
 
 
269 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.886076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1053  beta-lactamase class D  50.57 
 
 
295 aa  274  1e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1588  hypothetical protein  40.93 
 
 
266 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1405  hypothetical protein  40.15 
 
 
266 aa  198  8e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0077  hypothetical protein  38.61 
 
 
266 aa  196  4e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  hitchhiker  0.00231876  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0389  Beta-lactamase  41.91 
 
 
281 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.384736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1441  Beta-lactamase  40.82 
 
 
279 aa  174  2e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.653891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0184  Beta-lactamase  33.63 
 
 
288 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0120  Beta-lactamase  31.72 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0951  Beta-lactamase  30 
 
 
268 aa  93.6  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  30.48 
 
 
585 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  30.48 
 
 
585 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  30.48 
 
 
585 aa  92.4  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3220  Beta-lactamase  28.88 
 
 
268 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0828246  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0837  beta-lactamase, putative  32.81 
 
 
265 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3505  Beta-lactamase  26.92 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0483  putative beta-lactamase  28 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2637  Beta-lactamase  28.88 
 
 
279 aa  86.7  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.578583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1887  beta-lactamase class D  29.95 
 
 
272 aa  86.3  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.131226  normal  0.0179427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4075  Beta-lactamase  27.86 
 
 
271 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.709144 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5028  Beta-lactamase (OXA-5), class D  29.63 
 
 
272 aa  85.9  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3962  Beta-lactamase  27.86 
 
 
271 aa  85.9  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3440  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.25 
 
 
265 aa  85.1  1e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0522212  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  27.08 
 
 
596 aa  85.1  1e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0694  Beta-lactamase  31.25 
 
 
265 aa  85.1  1e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  5.96311e-06  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3353  Beta-lactamase  25.23 
 
 
277 aa  85.1  1e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  24.88 
 
 
585 aa  84.7  2e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3328  Beta-lactamase  31.25 
 
 
265 aa  84.7  2e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.306621  normal  0.885767 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  26.61 
 
 
585 aa  84  3e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0301  Beta-lactamase  25 
 
 
264 aa  83.2  5e-15  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  2.9774e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  26.61 
 
 
405 aa  81.6  1e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  26.61 
 
 
585 aa  81.3  2e-14  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8961  Beta-lactamase  28.81 
 
 
302 aa  81.3  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3398  Beta-lactamase  29 
 
 
272 aa  81.3  2e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.437274  normal  0.130069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3016  Beta-lactamase  30.52 
 
 
264 aa  81.6  2e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.535281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3124  Beta-lactamase  28.87 
 
 
271 aa  80.9  3e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2477  Beta-lactamase  28.88 
 
 
260 aa  80.1  4e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2332  Beta-lactamase  32.24 
 
 
266 aa  80.5  4e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.428372  normal  0.506587 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3157  Beta-lactamase  29.35 
 
 
270 aa  80.1  5e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0838  Beta-lactamase  29.17 
 
 
295 aa  80.1  5e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  4.82216e-05 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2340  twin-arginine translocation pathway signal  30.21 
 
 
272 aa  79.7  6e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0669803  normal  0.380486 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0813  Beta-lactamase  28.65 
 
 
295 aa  78.6  1e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00568131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0845  Beta-lactamase  28.65 
 
 
295 aa  77.8  2e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.965986  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3522  Beta-lactamase  28.12 
 
 
295 aa  76.6  5e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000389124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72760  putative beta-lactamase  28.93 
 
 
262 aa  75.9  8e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40823  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1109  Beta-lactamase  28.92 
 
 
261 aa  74.3  3e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00564969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6316  beta-lactamase PSE-2  28.93 
 
 
262 aa  73.6  4e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0412  penicillin-binding protein, transpeptidase  24.52 
 
 
283 aa  72.8  8e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1276  Beta-lactamase  27.15 
 
 
272 aa  71.6  2e-11  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1596  Beta-lactamase  26.34 
 
 
263 aa  70.5  4e-11  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569759  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1050  Beta-lactamase  27.23 
 
 
262 aa  67  4e-10  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0211  Beta-lactamase  27.85 
 
 
274 aa  67  4e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0427  Beta-lactamase  28.72 
 
 
306 aa  65.9  9e-10  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284518  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2220  beta-lactamase  28.99 
 
 
282 aa  65.5  1e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.526982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0907  Beta-lactamase  24.29 
 
 
267 aa  64.3  3e-09  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.175545  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0344  beta-lactamase  24.57 
 
 
253 aa  62.8  7e-09  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.148651  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1383  conserved hypothetical protein, possible beta-lactamase  26.04 
 
 
248 aa  62.4  9e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0424  Beta-lactamase  24.83 
 
 
271 aa  61.6  2e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2040  Beta-lactamase  26.07 
 
 
300 aa  53.9  3e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1435  Beta-lactamase  25.34 
 
 
262 aa  54.3  3e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.716267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>