More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3426 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3426  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 402 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4900  aminotransferase, class I and II  94.26 
 
 		 402 aa  768    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4437  aminotransferase class I and II  97.76 
 
 		 402 aa  796    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3263  aminotransferase, class I and II  94.26 
 
 		 402 aa  768    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0613421 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6907  aminotransferase, class I and II  94.26 
 
 		 402 aa  770    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2106  aminotransferase class I and II  71.28 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10930  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  45.61 
 
 		 405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.34112  unclonable  0.00000000328438 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1798  aminotransferase class I and II  39.45 
 
 		 401 aa  280  3e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.231865  decreased coverage  0.00490187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2760  aminotransferase, classes I and II  38.48 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000303791  hitchhiker  0.00674089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1417  aminotransferase class I and II  38.48 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1307  aminotransferase, classes I and II  38.48 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.516334  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10650  bifunctional PLP-dependent enzyme with beta-cystathionase and maltose regulon repressor activities  40.64 
 
 		 394 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00865596  hitchhiker  0.0000000299069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3010  aminotransferase class I and II  38.5 
 
 		 386 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0415  aminotransferase class I and II  38.75 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.671912  hitchhiker  0.000132671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0239  aminotransferase, class II  38.75 
 
 		 385 aa  265  7e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736512  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3185  aminotransferase class I and II  35.82 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2864  aminotransferase class I and II  37.91 
 
 		 386 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0289  aminotransferase class I and II  34.33 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2969  aminotransferase class I and II  35.77 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00560141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1855  aminotransferase class I and II  36.59 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3806  aminotransferase, class I and II  36.41 
 
 		 393 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1758  aminotransferase class I and II  36.36 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5050  aminotransferase, classes I and II  33.67 
 
 		 383 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5045  aminotransferase, classes I and II  33.67 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1021  aminotransferase, classes I and II  37.16 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4616  aminotransferase, classes I and II  33.67 
 
 		 383 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0196  aminotransferase, classes I and II  34.43 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4728  aminotransferase class I and II  33.92 
 
 		 383 aa  250  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4638  aminotransferase, classes I and II  33.42 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5038  aminotransferase, classes I and II  33.92 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.539983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5017  aminotransferase, classes I and II  33.42 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4223  aminotransferase class I and II  34.99 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000474096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4776  aminotransferase, classes I and II  33.16 
 
 		 383 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5138  aminotransferase, classes I and II  33.16 
 
 		 383 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7854  aminotransferase class I and II  36.18 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0455  aminotransferase class I and II  34.81 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000548039  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0087  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 389 aa  242  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3517  aminotransferase class I and II  34.5 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2256  aminotransferase, class I and II  34.24 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0013  aminotransferase, class I and II  35.82 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.085137 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1077  aminotransferase class I and II  38.4 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0481  aminotransferase, class I and II  34.31 
 
 		 394 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2804  aminotransferase class I and II  36.43 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2797  aminotransferase, class I and II  35.35 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.717105 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2800  aminotransferase, class I and II  37.22 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000680188  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2102  aminotransferase class I and II  33.82 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1912  aminotransferase, class I and II  33.99 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1968  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.858367  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1857  aminotransferase, classes I and II  33.33 
 
 		 392 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0327  aminotransferase, class II  33 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0342316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1822  aminotransferase class I and II  34.71 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1376  aminotransferase, class I and II  36.39 
 
 		 392 aa  223  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1001  aminotransferase, class II  31.49 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000156908  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1669  hemolysin  32.26 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000868394  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0012  aminotransferase, class I and II  34.75 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1259  aminotransferase, class I and II  34.81 
 
 		 372 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0917  aminotransferase class I and II  35.57 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388923  unclonable  5.819700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  34.66 
 
 		 521 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1610  putative aminotransferase class I and II  35.07 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.402267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2410  hemolysin  33.88 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0871  putative aminotransferase  34.49 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.440512  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3618  aminotransferase class I and II  32.65 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.276763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0703  aminotransferase, class I and II  35.12 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0598  aminotransferase class I and II  32.34 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.012306  normal  0.353633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3031  putative aminotransferase  36.59 
 
 		 381 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000416909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2531  aminotransferase, class I and II  34.24 
 
 		 390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.192793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0299  aminotransferase class I and II  35.12 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0832158  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1624  aminotransferase class I and II  31.22 
 
 		 402 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.514192  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0147  aminotransferase, class I and II  34 
 
 		 390 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.600776  normal  0.9689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1447  aminotransferase class I and II  38.08 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000231865  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6111  aminotransferase class I and II  33.5 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0264  aminotransferase class I and II  32.8 
 
 		 399 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000105319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3036  aminotransferase, class I and II  36.74 
 
 		 385 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1542  aminotransferase, class I and II  31.51 
 
 		 395 aa  206  7e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0056  aminotransferase class I and II  36.88 
 
 		 385 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0932  aminotransferase class I and II  34.22 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0054  aminotransferase class I and II  36.21 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000177087 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0391  aminotransferase (class II)  32.21 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1614  cystathionine beta-lyase  33.6 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.475755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2977  aminotransferase class I and II  33.91 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.792823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2020  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.07254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1577  maltose regulon modulator MalY  32.13 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1810  maltose regulon modulator MalY  32.13 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3628  aminotransferase, class I and II  32.92 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1697  MalY protein  32.13 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2008  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00273969  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2262  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.222348  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01591  bifunctional beta-cystathionase, PLP-dependent/ regulator of maltose regulon  32.13 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01581  hypothetical protein  32.13 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.165186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2334  MalY protein  32.13 
 
 		 390 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0276  aminotransferase, classes I and II  33.82 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1830  MalY protein  31.86 
 
 		 390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3512  aminotransferase class I and II  34.89 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457488  normal  0.584325 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2187  bifunctional beta-cystathionase/maltose regulon repressor  31.56 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1669  aminotransferase class I and II  32.83 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1786  aminotransferase  32.83 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.643003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3693  aminotransferase class I and II  35.41 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1671  aminotransferase class I and II  32.83 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1826  aminotransferase, class I and II  31.58 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0210496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1562  protein MalY  31.5 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00682434  normal  0.389614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>