More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1593 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1593  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000136963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3361  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.148624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3009  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
289 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0278836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3974  F0F1 ATP synthase subunit A  99.65 
 
 
289 aa  575  1e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4048  F0F1 ATP synthase subunit A  99.65 
 
 
289 aa  575  1e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2951  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 
283 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.643382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0185  F0F1 ATP synthase subunit A  99.65 
 
 
283 aa  563  1e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.690271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3314  F0F1 ATP synthase subunit A  97.17 
 
 
283 aa  554  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000501735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0100  F0F1 ATP synthase subunit A  93.64 
 
 
283 aa  527  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0187478  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0116  F0F1 ATP synthase subunit A  93.99 
 
 
283 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452508  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2955  F0F1 ATP synthase subunit A  93.99 
 
 
283 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00187227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0100  F0F1 ATP synthase subunit A  93.99 
 
 
283 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0388655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3282  F0F1 ATP synthase subunit A  93.64 
 
 
283 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.226754  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0100  F0F1 ATP synthase subunit A  93.29 
 
 
282 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0156743  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0091  F0F1 ATP synthase subunit A  93.29 
 
 
282 aa  517  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000844383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3033  F0F1 ATP synthase subunit A  90.81 
 
 
283 aa  514  1e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0034  F0F1 ATP synthase subunit A  88.34 
 
 
283 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0259709  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3900  F0F1 ATP synthase subunit A  88.34 
 
 
283 aa  502  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3500  F0F1 ATP synthase subunit A  64.58 
 
 
289 aa  363  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000120321  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3518  F0F1 ATP synthase subunit A  66.91 
 
 
293 aa  361  9e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0559287  hitchhiker  6.50144e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3193  F0F1 ATP synthase subunit A  66.91 
 
 
293 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.586213  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3352  F0F1 ATP synthase subunit A  63.51 
 
 
288 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573552  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3323  F0F1 ATP synthase subunit A  65.82 
 
 
307 aa  351  8e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000145119  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0020  F0F1 ATP synthase subunit A  61.27 
 
 
291 aa  346  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00150016  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0016  F0F1 ATP synthase subunit A  58.8 
 
 
291 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  2.60212e-11  hitchhiker  0.000221362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0209  F0F1 ATP synthase subunit A  62.89 
 
 
283 aa  329  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0414  F0F1 ATP synthase subunit A  59.09 
 
 
287 aa  310  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.266481  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4876  F0F1 ATP synthase subunit A  55.56 
 
 
289 aa  307  1e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0366  F0F1 ATP synthase subunit A  57.97 
 
 
292 aa  307  1e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.864806  normal  0.428998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0191  F0F1 ATP synthase subunit A  55.29 
 
 
290 aa  305  4e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.6509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0321  F0F1 ATP synthase subunit A  53.29 
 
 
292 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406347  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0297  F0F1 ATP synthase subunit A  59.09 
 
 
287 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0761923  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0302  F0F1 ATP synthase subunit A  58.39 
 
 
287 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0249  F0F1 ATP synthase subunit A  52.68 
 
 
297 aa  284  1e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0112  F0F1 ATP synthase subunit A  52.86 
 
 
296 aa  282  4e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.000328836  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0474  F0F1 ATP synthase subunit A  55.97 
 
 
287 aa  279  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.152355  normal  0.66197 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3532  F0F1 ATP synthase subunit A  54.13 
 
 
298 aa  279  4e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0443347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2750  F0F1 ATP synthase subunit A  50.71 
 
 
267 aa  261  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.90697e-05  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3065  F0F1 ATP synthase subunit A  48.75 
 
 
270 aa  248  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0304  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 
268 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  2.78138e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2522  F0F1 ATP synthase subunit A  48.75 
 
 
270 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.45329e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4096  F0F1 ATP synthase subunit A  49.13 
 
 
271 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  5.20187e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4202  F0F1 ATP synthase subunit A  49.13 
 
 
271 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109875  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4152  F0F1 ATP synthase subunit A  49.13 
 
 
271 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00217219  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4261  F0F1 ATP synthase subunit A  49.13 
 
 
271 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4081  F0F1 ATP synthase subunit A  49.13 
 
 
271 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00982626  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0056  F0F1 ATP synthase subunit A  50 
 
 
261 aa  241  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002024  ATP synthase A chain  48.75 
 
 
270 aa  239  3e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.82901e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00428  F0F1 ATP synthase subunit A  48.04 
 
 
270 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4904  F0F1 ATP synthase subunit A  46.59 
 
 
264 aa  234  1e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  5.12006e-07  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3931  F0F1 ATP synthase subunit A  47.48 
 
 
264 aa  233  2e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  9.07169e-05  hitchhiker  0.00676688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4023  F0F1 ATP synthase subunit A  47.48 
 
 
264 aa  233  2e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.040016  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4136  F0F1 ATP synthase subunit A  47.84 
 
 
264 aa  233  2e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.52507e-05  hitchhiker  0.00113608 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0006  F0F1 ATP synthase subunit A  49.11 
 
 
259 aa  233  3e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.219933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3851  F0F1 ATP synthase subunit A  47.65 
 
 
264 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.51121e-06  hitchhiker  2.72829e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4188  F0F1 ATP synthase subunit A  47.52 
 
 
263 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.18373e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4753  F0F1 ATP synthase subunit A  47.12 
 
 
264 aa  231  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4126  F0F1 ATP synthase subunit A  47.74 
 
 
271 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  4.92327e-07  normal  0.286838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3650  F0F1 ATP synthase subunit A  46.79 
 
 
264 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.46441e-06  unclonable  7.39307e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4541  F0F1 ATP synthase subunit A  46.37 
 
 
266 aa  230  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  3.89155e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4251  F0F1 ATP synthase subunit A  46.37 
 
 
266 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04089  F0F1 ATP synthase subunit A  46.78 
 
 
277 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0056302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5605  ATP synthase F0, A subunit  48.8 
 
 
289 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5127  F0F1 ATP synthase subunit A  49.14 
 
 
289 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00619657  normal  0.911189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4613  F0F1 ATP synthase subunit A  47.24 
 
 
272 aa  228  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0002  F0F1 ATP synthase subunit A  47.42 
 
 
273 aa  228  9e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.55904e-07  hitchhiker  0.00410129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4051  F0F1 ATP synthase subunit A  47.08 
 
 
264 aa  228  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4220  F0F1 ATP synthase subunit A  46.21 
 
 
274 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  1.14872e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4513  F0F1 ATP synthase subunit A  46.01 
 
 
264 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00041275  normal  0.0282982 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4316  F0F1 ATP synthase subunit A  46.01 
 
 
264 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00103283  hitchhiker  1.08391e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4372  F0F1 ATP synthase subunit A  46.01 
 
 
264 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.88927e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4182  F0F1 ATP synthase subunit A  46.21 
 
 
274 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.5941e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4301  F0F1 ATP synthase subunit A  46.05 
 
 
270 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0268384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4106  F0F1 ATP synthase subunit A  48.43 
 
 
271 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.06624e-06  normal  0.0652596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4371  F0F1 ATP synthase subunit A  44.91 
 
 
278 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.24643e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3758  F0F1 ATP synthase subunit A  47.29 
 
 
264 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000113424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4492  F0F1 ATP synthase subunit A  44.77 
 
 
264 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  6.48141e-06 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5736  F0F1 ATP synthase subunit A  48.81 
 
 
289 aa  225  5e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000306084  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2916  F0F1 ATP synthase subunit A  45.42 
 
 
278 aa  225  5e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3059  F0F1 ATP synthase subunit A  45.42 
 
 
278 aa  225  5e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3987  ATP synthase F0, A subunit  48.24 
 
 
260 aa  224  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3962  F0F1 ATP synthase subunit A  45.64 
 
 
273 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4256  F0F1 ATP synthase subunit A  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  7.69313e-06  hitchhiker  0.00779566 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4229  ATP synthase F0, A subunit  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.42751e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52220  F0F1 ATP synthase subunit A  47.26 
 
 
272 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5174  F0F1 ATP synthase subunit A  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.80293e-07  normal  0.0140934 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3954  F0F1 ATP synthase subunit A  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.90174e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03566  hypothetical protein  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000247558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4254  F0F1 ATP synthase subunit A  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.53888e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03622  F0F1 ATP synthase subunit A  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000418206  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4183  F0F1 ATP synthase subunit A  48.08 
 
 
271 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  1.8126e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06110  F0F1 ATP synthase subunit A  47.06 
 
 
255 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4246  F0F1 ATP synthase subunit A  45.7 
 
 
276 aa  222  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.11234e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6362  F0F1 ATP synthase subunit A  45.3 
 
 
289 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73310  F0F1 ATP synthase subunit A  45.3 
 
 
289 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.529883  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4208  F0F1 ATP synthase subunit A  50.61 
 
 
252 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.00849e-05  normal  0.161523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3517  F0F1 ATP synthase subunit A  42.55 
 
 
266 aa  218  8e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5419  F0F1 ATP synthase subunit A  47.26 
 
 
289 aa  218  8e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5301  F0F1 ATP synthase subunit A  47.26 
 
 
289 aa  218  9e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5437  F0F1 ATP synthase subunit A  46.92 
 
 
289 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>