More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1869 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 141 aa  283  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  88.55 
 
 		 141 aa  238  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  90 
 
 		 140 aa  236  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  89.23 
 
 		 140 aa  236  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  84.73 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  84.73 
 
 		 142 aa  226  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  77.7 
 
 		 141 aa  221  2e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  84.38 
 
 		 142 aa  221  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  81.68 
 
 		 143 aa  221  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  70.5 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  77.42 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  71.32 
 
 		 138 aa  201  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  72.46 
 
 		 138 aa  200  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  77.42 
 
 		 138 aa  199  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  67.38 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  66.91 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  68.38 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  77.42 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  76.61 
 
 		 136 aa  197  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  71.63 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  67.14 
 
 		 140 aa  196  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  75.81 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  66.19 
 
 		 141 aa  192  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  67.16 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  67.16 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  73.39 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  67.91 
 
 		 139 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  64.54 
 
 		 138 aa  190  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  70.97 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  66.67 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 		 136 aa  186  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  63.83 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  65.25 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  67.74 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  65.32 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  58.57 
 
 		 139 aa  164  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  62.02 
 
 		 184 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  58.16 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  63.64 
 
 		 178 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  59.26 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3311  50S ribosomal protein L17  61.86 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.666345  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  56.03 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  59.84 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  57.46 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  61.54 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  57.48 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  59.84 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3474  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 125 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0303  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.566479  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2732  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0294  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  57.58 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  58.68 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  58.68 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0480  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4723  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51527  normal  0.268012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0513  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0509  50S ribosomal protein L17  60 
 
 		 128 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  59.17 
 
 		 132 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  56.69 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  58.33 
 
 		 126 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  59.32 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  50.35 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  58.68 
 
 		 130 aa  148  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  56.39 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  56.39 
 
 		 129 aa  148  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>