60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3590 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3590  HAD family hydrolase  100 
 
 
270 aa  560  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.684772  normal  0.0477257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3874  HAD family hydrolase  56 
 
 
260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0597322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0088  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  58.58 
 
 
265 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  54.77 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0566  HAD family hydrolase  48.98 
 
 
251 aa  222  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0688357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0610  HAD family hydrolase  33.46 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000152168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2097  HAD family hydrolase  30.15 
 
 
268 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.978592  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2700  HAD family hydrolase  29.8 
 
 
270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5196  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  30.51 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2056  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.413042  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1184  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.27 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.24726  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1091  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.27 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.024164  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2219  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
259 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2053  HAD family hydrolase  32.47 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4133  HAD family hydrolase  30.86 
 
 
271 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1263  hypothetical protein  31.47 
 
 
295 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.151023  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0769  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
257 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0183682  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6760  HAD family hydrolase  31.15 
 
 
263 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3500  HAD family hydrolase  28.19 
 
 
267 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1558  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
263 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6271  HAD family hydrolase  30.04 
 
 
263 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274563  normal  0.690052 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5210  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.32 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.43756 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0595  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.3 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0616  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
278 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4690  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.34 
 
 
275 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5932  HAD family hydrolase  28.34 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06400  hypothetical protein  28.09 
 
 
274 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4067  HAD family hydrolase  27.31 
 
 
301 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0644  HAD family hydrolase  28.85 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1633  SPP-like hydrolase  26.91 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.64059  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0884  SPP-like hydrolase  26.98 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0685  SPP-like hydrolase  26.75 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2939  SPP-like hydrolase  24.58 
 
 
232 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000389482  normal  0.976262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  27.42 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1070  SPP-like hydrolase  24.08 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0195406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1919  SPP-like hydrolase  25.21 
 
 
234 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.88 
 
 
282 aa  50.8  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  26.64 
 
 
265 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0788  SPP-like hydrolase  23.65 
 
 
228 aa  48.9  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00672208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1727  HAD family hydrolase  27.76 
 
 
227 aa  48.9  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  39.19 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  20.6 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.87 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  23.67 
 
 
226 aa  46.2  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1117  HAD family hydrolase  23.67 
 
 
554 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.293003  normal  0.951396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1100  HAD family hydrolase  23.67 
 
 
554 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.261757  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2100  SPP-like hydrolase  24.37 
 
 
232 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.03 
 
 
265 aa  45.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.24 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl481  HAD-superfamily cof-like hydrolase  40.74 
 
 
282 aa  45.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  27.64 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  36.49 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  21.07 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2353  Cof-like hydrolase  23.47 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1423  HAD family hydrolase  23.44 
 
 
550 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  36.84 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1965  SPP-like hydrolase  23.46 
 
 
230 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0481119  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0041  SPP-like hydrolase  25.2 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3274  Cof protein  27.78 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0388  HAD superfamily hydrolase  23.66 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>