28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3197 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  100 
 
 
634 aa  1298  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  5.40143e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  30.56 
 
 
615 aa  258  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  29.56 
 
 
623 aa  236  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 
645 aa  233  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  27.81 
 
 
617 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  27.96 
 
 
620 aa  201  4e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3734  hypothetical protein  31.23 
 
 
432 aa  123  1e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 
623 aa  96.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  29.07 
 
 
503 aa  94.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
522 aa  92.8  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  27.86 
 
 
510 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  25.58 
 
 
773 aa  72  3e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  25.61 
 
 
713 aa  67.8  6e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1993  peptidase M48, Ste24p  26.88 
 
 
615 aa  62.8  2e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2898  peptidase M48 Ste24p  25.82 
 
 
621 aa  59.3  2e-07  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0804382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 
708 aa  57.4  8e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2910  peptidase M48 Ste24p  24.83 
 
 
420 aa  57  1e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.66586e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  28.07 
 
 
495 aa  56.2  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1277  Ste24 endopeptidase  32.54 
 
 
417 aa  53.1  1e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0166369  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2298  peptidase M48, Ste24p  34.07 
 
 
420 aa  51.6  4e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2206  heat shock protein HtpX  25.66 
 
 
300 aa  51.2  5e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.116706  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0554  heat shock protein HtpX  25.66 
 
 
300 aa  51.2  6e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  25.44 
 
 
299 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  28.05 
 
 
495 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0524  Ste24 endopeptidase  30.16 
 
 
417 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0944212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 
281 aa  47  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0109  peptidase M48, Ste24p  35 
 
 
421 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.35832e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  25.17 
 
 
285 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>