55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2093 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  100 
 
 		 313 aa  617  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  91.69 
 
 		 313 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  61.41 
 
 		 406 aa  351  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  62.46 
 
 		 379 aa  342  5e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  61.02 
 
 		 313 aa  336  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  55.96 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  55.56 
 
 		 338 aa  321  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  55.73 
 
 		 430 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  51.95 
 
 		 313 aa  298  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  52.48 
 
 		 310 aa  298  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  54.61 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  52.98 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  49.68 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  49.67 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  50.33 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  50.33 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  50.33 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  46.08 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  45.45 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  47.14 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  40.6 
 
 		 341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  47.64 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  46.44 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  44.26 
 
 		 376 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  48.49 
 
 		 302 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  45.03 
 
 		 571 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  44.52 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  46.6 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  47.46 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  44.11 
 
 		 314 aa  208  8e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  42.71 
 
 		 308 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  40.84 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  40 
 
 		 373 aa  175  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  38.36 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  39.05 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  37.7 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  39.03 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  36.88 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.82 
 
 		 356 aa  65.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  33.76 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  32.95 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  26.54 
 
 		 370 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.55 
 
 		 435 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1683  OpcA  25.37 
 
 		 458 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  30.77 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  30.56 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4316  OpcA protein  25 
 
 		 445 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362638  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.06 
 
 		 429 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  25.48 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  37.65 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.09 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  26.62 
 
 		 445 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  30.07 
 
 		 435 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11801  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.04 
 
 		 433 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1092  OpcA protein  25.6 
 
 		 457 aa  42.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>