More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0092 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  100 
 
 
472 aa  961  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0153  fumarase  54.82 
 
 
476 aa  481  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  51.85 
 
 
479 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 
471 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.22515e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
479 aa  473  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
476 aa  472  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
479 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
479 aa  471  1e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
479 aa  471  1e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
479 aa  469  1e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
479 aa  471  1e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  49.69 
 
 
481 aa  462  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
479 aa  459  1e-128  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42722e-05 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
479 aa  459  1e-128  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
476 aa  459  1e-128  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  48.71 
 
 
469 aa  459  1e-128  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
476 aa  460  1e-128  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  51.09 
 
 
474 aa  461  1e-128  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.33495e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
468 aa  458  1e-128  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 
474 aa  461  1e-128  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
479 aa  459  1e-128  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
468 aa  459  1e-128  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
479 aa  460  1e-128  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
468 aa  459  1e-128  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
476 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
476 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
476 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  52.72 
 
 
471 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
476 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  452  1e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
485 aa  454  1e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 
477 aa  454  1e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  454  1e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
478 aa  453  1e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  52.49 
 
 
483 aa  454  1e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 
485 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  454  1e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  452  1e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01511e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  452  1e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 
476 aa  454  1e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
478 aa  452  1e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 
471 aa  454  1e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  452  1e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 
477 aa  453  1e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  52.16 
 
 
475 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  50.33 
 
 
471 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  51.29 
 
 
468 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 
477 aa  450  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 
485 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  50.97 
 
 
475 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
477 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
466 aa  446  1e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  47.03 
 
 
480 aa  446  1e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  48.15 
 
 
467 aa  445  1e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  50.98 
 
 
471 aa  445  1e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  52 
 
 
461 aa  446  1e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 
479 aa  448  1e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
472 aa  446  1e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
468 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
468 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
474 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 
474 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
468 aa  442  1e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 
474 aa  441  1e-122  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
468 aa  440  1e-122  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 
463 aa  440  1e-122  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  50.88 
 
 
471 aa  441  1e-122  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  51.07 
 
 
540 aa  438  1e-122  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  48.8 
 
 
475 aa  440  1e-122  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 
474 aa  441  1e-122  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  49.03 
 
 
474 aa  438  1e-122  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  48.92 
 
 
478 aa  436  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  49.24 
 
 
469 aa  438  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  48.81 
 
 
474 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  47.71 
 
 
505 aa  435  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 
476 aa  436  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  48.47 
 
 
476 aa  436  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.29353e-06 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  51.34 
 
 
479 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  47.65 
 
 
484 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  49.89 
 
 
484 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  9.34378e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  48.91 
 
 
463 aa  432  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  50.76 
 
 
481 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  47.71 
 
 
466 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  49.02 
 
 
470 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  47.83 
 
 
560 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 
485 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  1.50136e-06 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  47.49 
 
 
466 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  49.24 
 
 
463 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 
467 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
468 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
468 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  47.84 
 
 
466 aa  431  1e-119  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  49.78 
 
 
507 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  47.61 
 
 
568 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  47.49 
 
 
475 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  47.61 
 
 
571 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  48.7 
 
 
483 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  49.23 
 
 
478 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  46.85 
 
 
467 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>