More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1343 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
394 aa  795    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  46.97 
 
 
395 aa  315  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  45.18 
 
 
425 aa  295  7e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  44.77 
 
 
452 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  34.68 
 
 
463 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  35.62 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  34.46 
 
 
478 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  48.28 
 
 
507 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.42 
 
 
482 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.98 
 
 
237 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  32.91 
 
 
462 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  31.42 
 
 
441 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  44.3 
 
 
236 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  43.46 
 
 
500 aa  180  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  45 
 
 
472 aa  180  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  43.93 
 
 
466 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  39.26 
 
 
245 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  44.17 
 
 
469 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  41.59 
 
 
416 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  32.1 
 
 
474 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  39.85 
 
 
267 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  42.45 
 
 
426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  43.03 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  42.86 
 
 
463 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  41.63 
 
 
323 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  41.7 
 
 
540 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  42.19 
 
 
554 aa  170  5e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  44.74 
 
 
467 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  38.81 
 
 
449 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.36 
 
 
438 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  43.21 
 
 
519 aa  169  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  43.03 
 
 
449 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.16 
 
 
239 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  40 
 
 
505 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.57 
 
 
280 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  42.92 
 
 
478 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  43.78 
 
 
239 aa  166  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  41.53 
 
 
264 aa  166  8e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  36.17 
 
 
236 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  42.68 
 
 
477 aa  166  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  45.23 
 
 
479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  41.95 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  36.11 
 
 
257 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.56 
 
 
236 aa  163  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  41.3 
 
 
564 aa  162  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  40.55 
 
 
597 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  37.86 
 
 
386 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.8 
 
 
470 aa  161  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  39.51 
 
 
319 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.97 
 
 
247 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
236 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  42.31 
 
 
265 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  39.68 
 
 
348 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.53 
 
 
611 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  40.65 
 
 
247 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  41.98 
 
 
519 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  39.51 
 
 
258 aa  158  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  42.48 
 
 
474 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  41.42 
 
 
256 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  41.84 
 
 
305 aa  157  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  41.03 
 
 
234 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  38.24 
 
 
252 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  40.08 
 
 
256 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.52 
 
 
516 aa  155  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 
259 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 
259 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  42.74 
 
 
252 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  40.09 
 
 
241 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  39.74 
 
 
234 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40 
 
 
241 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  40.5 
 
 
287 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  42.26 
 
 
285 aa  153  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.71 
 
 
238 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.07 
 
 
517 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1324  protein serine/threonine phosphatase  39.26 
 
 
253 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  37.3 
 
 
256 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 
548 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  35.77 
 
 
417 aa  151  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  41.26 
 
 
514 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
256 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  39.74 
 
 
241 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
256 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
256 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  39.11 
 
 
259 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
240 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  42.74 
 
 
262 aa  150  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
256 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  35.41 
 
 
389 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  43.48 
 
 
511 aa  150  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  35.97 
 
 
574 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  37.55 
 
 
241 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  40.6 
 
 
320 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  41.63 
 
 
239 aa  150  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  40.62 
 
 
491 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.62 
 
 
491 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.62 
 
 
491 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  38.67 
 
 
435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  40.62 
 
 
296 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>