111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0905 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0905  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
187 aa  388  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0820  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.72 
 
 
243 aa  96.7  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0420468 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.72 
 
 
209 aa  95.5  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.343  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2106  hypothetical protein  39.25 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1584  hypothetical protein  38.32 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.871855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3448  hypothetical protein  37.19 
 
 
537 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1284  hypothetical protein  39.45 
 
 
418 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257674  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2344  hypothetical protein  37.04 
 
 
520 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576103  normal  0.151104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0922  hypothetical protein  43.27 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1376  hypothetical protein  38.53 
 
 
419 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2942  hypothetical protein  37.19 
 
 
575 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3881  hypothetical protein  33.93 
 
 
568 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.285346 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3070  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  42.35 
 
 
230 aa  71.6  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0980  hypothetical protein  42.35 
 
 
361 aa  71.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.278264  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2501  hypothetical protein  35.19 
 
 
588 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.732185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3470  hypothetical protein  42.86 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424807  hitchhiker  0.00000991217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3099  hypothetical protein  43.02 
 
 
349 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1744  hypothetical protein  34.86 
 
 
411 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2782  hypothetical protein  36.45 
 
 
503 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519133  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4300  hypothetical protein  38.82 
 
 
519 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2818  hypothetical protein  34.58 
 
 
536 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4791  hypothetical protein  43.84 
 
 
354 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.884307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54810  hypothetical protein  43.84 
 
 
347 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000274874  hitchhiker  6.2392400000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3408  hypothetical protein  33.33 
 
 
496 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0116345  normal  0.112401 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1779  hypothetical protein  35.71 
 
 
344 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3965  hypothetical protein  40 
 
 
520 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2723  hypothetical protein  40.7 
 
 
455 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2111  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.37 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.405702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0164  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.4 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3565  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.29 
 
 
294 aa  57.8  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0082  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.91 
 
 
368 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.13 
 
 
217 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0832  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.65 
 
 
257 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.524335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.76 
 
 
112 aa  54.7  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1319  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.61 
 
 
142 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal  0.132839 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0385  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.22 
 
 
292 aa  54.3  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310092  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  23.88 
 
 
411 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1842  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.0087761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.17 
 
 
260 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1237  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.38 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3286  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.35 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0799688  normal  0.416162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.84 
 
 
216 aa  52.4  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3373  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.37 
 
 
270 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5042  hitchhiker  0.00517308 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2364  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.77 
 
 
270 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0212469  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0722  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.12 
 
 
144 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.728522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1993  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.37 
 
 
268 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1263  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
235 aa  51.6  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0095  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.13 
 
 
291 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000029403  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0947  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.21 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2919  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.77 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265535  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3219  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.56 
 
 
204 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2016  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.31 
 
 
253 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2743  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.16 
 
 
269 aa  48.9  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.48 
 
 
289 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10117  hypothetical protein  25.9 
 
 
251 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5913  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.37 
 
 
209 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1503  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.47 
 
 
250 aa  48.5  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4515  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.11 
 
 
256 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.07 
 
 
212 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3023  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.73 
 
 
214 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00777053  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2980  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.17 
 
 
300 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6152  hypothetical protein  31.03 
 
 
264 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  0.0289624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30.95 
 
 
272 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.43 
 
 
231 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.93 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.13 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.73 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4392  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 
194 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3630  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.01 
 
 
211 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4455  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 
194 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.395262  normal  0.946705 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.57 
 
 
273 aa  46.2  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5175  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
475 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4815  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.72 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.56 
 
 
294 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2026  hypothetical protein  31.86 
 
 
303 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198404  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.25 
 
 
307 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0101  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.27 
 
 
294 aa  45.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4950  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.52 
 
 
206 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0475  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.62 
 
 
292 aa  45.1  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.216205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.19 
 
 
292 aa  45.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0476  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.26 
 
 
206 aa  45.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.84 
 
 
295 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1128  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 
425 aa  44.7  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.514766  normal  0.810512 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.96 
 
 
283 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2773  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.62 
 
 
249 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41568  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2759  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.62 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.450449  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.73 
 
 
398 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.49 
 
 
309 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.62 
 
 
280 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.656608  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1021  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28 
 
 
417 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.451264  normal  0.540486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3019  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.56 
 
 
266 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.258239  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1402  hypothetical protein  34.15 
 
 
276 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0083  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.3 
 
 
115 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1550  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.21 
 
 
278 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1054  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.7 
 
 
400 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3645  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.39 
 
 
394 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4055  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4372  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4170  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>