More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3453 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3453  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  100 
 
 
640 aa  1251    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000252279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19830  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  56.39 
 
 
641 aa  669    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646279  hitchhiker  0.000217512 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  48.69 
 
 
646 aa  537  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  47.35 
 
 
668 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3161  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  46.68 
 
 
662 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464305  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  43.44 
 
 
702 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  45.44 
 
 
626 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.79 
 
 
644 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  42.08 
 
 
661 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.19 
 
 
644 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.05 
 
 
644 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.72 
 
 
655 aa  414  1e-114  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  37.02 
 
 
644 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  37.17 
 
 
643 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.9 
 
 
644 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.56 
 
 
629 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0587  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  42.1 
 
 
623 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  41.68 
 
 
643 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  40.41 
 
 
643 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.86 
 
 
719 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0459  prolyl oligopeptidase family protein  38.28 
 
 
636 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1709  peptidase catalytic subunit  38.28 
 
 
636 aa  387  1e-106  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.69 
 
 
643 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.92 
 
 
663 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956088  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.39 
 
 
642 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0608  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  42.28 
 
 
645 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.65 
 
 
646 aa  363  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.36 
 
 
662 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  38.34 
 
 
693 aa  348  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.67 
 
 
683 aa  309  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.27 
 
 
675 aa  302  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.453566  normal  0.217574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1383  prolyl oligopeptidase family protein  33.84 
 
 
686 aa  299  9e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.82 
 
 
683 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.52 
 
 
677 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.5 
 
 
676 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.66 
 
 
682 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.66 
 
 
682 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.91 
 
 
677 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.66 
 
 
682 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.61 
 
 
677 aa  287  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.66 
 
 
682 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  31.59 
 
 
678 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.79 
 
 
677 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  28.1 
 
 
665 aa  273  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.76 
 
 
652 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00771  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.31 
 
 
645 aa  240  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.248963  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01331  esterase/lipase/thioesterase family protein  27.9 
 
 
644 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.180596  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1432  dienelactone hydrolase  27.8 
 
 
644 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.839365  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  31.6 
 
 
651 aa  236  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2275  putative peptidase  39.19 
 
 
635 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.573468  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0408  putative peptidase  33.54 
 
 
639 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.01 
 
 
574 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  31.69 
 
 
608 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.69 
 
 
652 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  31.96 
 
 
608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.6 
 
 
607 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.5 
 
 
608 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00801  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.25 
 
 
641 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.1 
 
 
607 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.05 
 
 
607 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  31.2 
 
 
612 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00811  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.06 
 
 
641 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0508  hypothetical protein  30.57 
 
 
610 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0071  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.39 
 
 
641 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00781  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.1 
 
 
642 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1960  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.08 
 
 
610 aa  173  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.317631  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.87 
 
 
656 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  27.71 
 
 
649 aa  120  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.46 
 
 
594 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.53 
 
 
674 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  32.77 
 
 
649 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.31 
 
 
695 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0132  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.09 
 
 
674 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0373  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.78 
 
 
662 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.265704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0384  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.41 
 
 
662 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290431  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0372  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.41 
 
 
662 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.11 
 
 
642 aa  104  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.59 
 
 
642 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0398  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.41 
 
 
662 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000316056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0114  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  26.51 
 
 
674 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1818  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.36 
 
 
692 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0201758  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.3 
 
 
596 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.82 
 
 
605 aa  101  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3485  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.34 
 
 
654 aa  101  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2007  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.24 
 
 
720 aa  100  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565221 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.52 
 
 
695 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00624  prolyl oligopeptidase  27.76 
 
 
653 aa  100  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.61 
 
 
606 aa  99.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.21 
 
 
612 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.16 
 
 
631 aa  99.8  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0469  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.51 
 
 
638 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  21.71 
 
 
685 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0381  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.84 
 
 
654 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.217468  unclonable  0.000000000177281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36290  prolyl oligopeptidase family protein  30.27 
 
 
609 aa  99.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278406  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.08 
 
 
632 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0148  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.78 
 
 
617 aa  99.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.554216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0227  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.47 
 
 
604 aa  98.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.07 
 
 
626 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.2 
 
 
661 aa  98.2  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.65 
 
 
626 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>