195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2382 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  100 
 
 
219 aa  417  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  58.25 
 
 
264 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  53.74 
 
 
228 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  50.73 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  54.21 
 
 
233 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  51 
 
 
279 aa  145  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  44.17 
 
 
237 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  46.77 
 
 
230 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  45.51 
 
 
224 aa  136  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  34.67 
 
 
224 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  38.83 
 
 
319 aa  105  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  32.24 
 
 
235 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  28.57 
 
 
220 aa  98.2  8e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  39.18 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  30.93 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  31.71 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  35.29 
 
 
234 aa  91.7  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  31.63 
 
 
243 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  33.01 
 
 
267 aa  88.2  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  32.91 
 
 
235 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  33.18 
 
 
250 aa  85.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  32.16 
 
 
243 aa  85.5  5e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  33.67 
 
 
267 aa  85.5  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  28.29 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  30.29 
 
 
242 aa  82  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  35.78 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  32.94 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  29.85 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  33.33 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  31.82 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  33.91 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  28.99 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  27.31 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  32.43 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  27.23 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1930  AzlC family protein  29.15 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.74 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  33.33 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  26.89 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  33.02 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  26.79 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  32.92 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  33.33 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  30.61 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0119  AzlC family protein  26.19 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  29.59 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  31.38 
 
 
307 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  32.66 
 
 
240 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1523  AzlC-like  32 
 
 
226 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.163351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  29.45 
 
 
230 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  29.88 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  32.95 
 
 
242 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.53 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  27.23 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  27.23 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2597  AzlC family protein  26.37 
 
 
248 aa  62.8  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.53 
 
 
241 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1402  AzlC family protein  28.9 
 
 
228 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000122963  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.17 
 
 
235 aa  62.8  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  27.27 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  27.27 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  27.27 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  27.27 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.76 
 
 
231 aa  62.4  0.000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  33.33 
 
 
258 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  27.27 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  27.27 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.27 
 
 
241 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  26.74 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27.75 
 
 
273 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  26.67 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.75 
 
 
273 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  27.75 
 
 
285 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1389  AzlC family protein  28.74 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000765167  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.06 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  29.28 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  31.29 
 
 
238 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  29.91 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0298  AzlC-like  29.26 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0377703  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.43 
 
 
273 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  27.95 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  30.86 
 
 
242 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  27.62 
 
 
230 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  31.14 
 
 
253 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  28.65 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  27.62 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0552  azaleucine resistance protein AzlC  29.27 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2893  AzlC family protein  28.16 
 
 
236 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.87729e-24 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0362  AzlC family protein  29.27 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0375  AzlC family protein  29.27 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.946761  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  27.62 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  22.34 
 
 
238 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0774  AzlC family protein  29.76 
 
 
246 aa  58.5  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  32.37 
 
 
242 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  26.02 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  26.02 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  26.32 
 
 
230 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  26.02 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  26.02 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  29.39 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>