More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0024 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  100 
 
 
487 aa  954  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  61.25 
 
 
543 aa  547  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  57.53 
 
 
470 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  54.23 
 
 
469 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  55.75 
 
 
470 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  55.75 
 
 
470 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  55.75 
 
 
470 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  53.42 
 
 
476 aa  472  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  56.88 
 
 
470 aa  461  1e-128  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  54.47 
 
 
487 aa  447  1e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  52.03 
 
 
493 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  50.53 
 
 
498 aa  433  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  54.8 
 
 
473 aa  417  1e-115  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  49.24 
 
 
468 aa  410  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  51.05 
 
 
475 aa  405  1e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  50.99 
 
 
496 aa  407  1e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  48.79 
 
 
496 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  50.8 
 
 
459 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  52.03 
 
 
533 aa  402  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  47.32 
 
 
460 aa  401  1e-110  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  47.38 
 
 
529 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  47.46 
 
 
459 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  48.22 
 
 
463 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  44.28 
 
 
659 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  47.03 
 
 
517 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  47.75 
 
 
457 aa  366  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  45.09 
 
 
496 aa  365  1e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  45.32 
 
 
486 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  45.67 
 
 
462 aa  356  6e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  43.81 
 
 
469 aa  349  8e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  46.38 
 
 
563 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  45.8 
 
 
463 aa  339  7e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  46.98 
 
 
493 aa  329  8e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  48.6 
 
 
494 aa  328  2e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  43.92 
 
 
519 aa  320  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  39.46 
 
 
517 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  45.93 
 
 
474 aa  316  5e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  42.64 
 
 
429 aa  306  6e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.14 
 
 
924 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  38.2 
 
 
921 aa  277  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  40.26 
 
 
480 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 
954 aa  269  9e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  38.78 
 
 
426 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  42.57 
 
 
435 aa  263  7e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  37.92 
 
 
441 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  39.32 
 
 
439 aa  248  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  37.73 
 
 
933 aa  246  7e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  39.23 
 
 
443 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  34.11 
 
 
414 aa  239  6e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.72052e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  39.64 
 
 
405 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  35.14 
 
 
428 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  37.16 
 
 
472 aa  236  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  38.86 
 
 
443 aa  234  2e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  39.43 
 
 
481 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  35.16 
 
 
472 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  36 
 
 
422 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  35.24 
 
 
480 aa  215  1e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  35.66 
 
 
463 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  38.18 
 
 
444 aa  210  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.95 
 
 
399 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  34.25 
 
 
422 aa  206  8e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  33.42 
 
 
409 aa  197  4e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  33.42 
 
 
409 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.78 
 
 
972 aa  174  2e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  35.9 
 
 
511 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  35.9 
 
 
511 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  35.9 
 
 
511 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  34.25 
 
 
368 aa  167  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  31.01 
 
 
368 aa  166  1e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  37.55 
 
 
365 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  37.5 
 
 
420 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  37.63 
 
 
423 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  34.71 
 
 
380 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1607  cell division protein FtsW  33.77 
 
 
396 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
501 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  39.15 
 
 
364 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  32.55 
 
 
367 aa  158  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  34.65 
 
 
506 aa  158  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  34.84 
 
 
365 aa  157  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  32.18 
 
 
367 aa  157  5e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  32.91 
 
 
387 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  34.6 
 
 
359 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  34.15 
 
 
375 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  35.31 
 
 
400 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  41.84 
 
 
374 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  29.52 
 
 
374 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6114  cell division protein FtsW  34.26 
 
 
417 aa  153  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309326  normal  0.0125207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  32.99 
 
 
374 aa  152  9e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0740  cell division protein FtsW  32.81 
 
 
380 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03259  cell division protein FtsW  35.6 
 
 
470 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3630  cell cycle protein  33.16 
 
 
363 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.907488 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  33.91 
 
 
377 aa  150  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4466  cell division protein FtsW  30.31 
 
 
437 aa  150  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  34.63 
 
 
354 aa  149  1e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  33.54 
 
 
365 aa  149  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.37002e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  34.19 
 
 
424 aa  149  1e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2113  stage V sporulation protein E  29.41 
 
 
374 aa  149  1e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.985663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1112  cell division protein FtsW  33.92 
 
 
393 aa  148  2e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  35.19 
 
 
412 aa  148  2e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0354  phosphopantetheine attachment site  34.67 
 
 
404 aa  149  2e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>