28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1270 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  99 
 
 		 300 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  75.33 
 
 		 298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  70.43 
 
 		 301 aa  437  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  44.15 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  24.18 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1739  hypothetical protein  30.49 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.878952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  24.52 
 
 		 490 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1515  hypothetical protein  23.73 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.107108  hitchhiker  0.0038288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0384  hypothetical protein  23.1 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  25.73 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  24.16 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0945  hypothetical protein  24.64 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523813  n/a   
 
 
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  23.86 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  26.71 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_50  hypothetical protein  23.4 
 
 		 424 aa  57  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00190835  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  24.56 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0126  hypothetical protein  21.57 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  23.25 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  24.25 
 
 		 321 aa  49.7  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1832  hypothetical protein  23.75 
 
 		 442 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  24.92 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2084  hypothetical protein  20.9 
 
 		 434 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0757382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  22.73 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  25 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0752  hypothetical protein  21.59 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194226 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  23.78 
 
 		 449 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  23.83 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>