14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0665 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0665  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7308  hypothetical protein  31.14 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000749019  hitchhiker  0.0000983885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3227  hypothetical protein  27.97 
 
 		 490 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.999144  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5161  hypothetical protein  25.5 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0502601  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2340  hypothetical protein  24.83 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000406719  unclonable  0.000000155562 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1233  hypothetical protein  21.38 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1270  hypothetical protein  24.16 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1829  hypothetical protein  23.47 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.660383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1034  hypothetical protein  24.24 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  25.32 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  23.38 
 
 		 363 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  23.55 
 
 		 449 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1036  hypothetical protein  22.22 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6926  DNA polymerase beta domain protein region  21.33 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000143596  hitchhiker  0.000343004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>