238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1677 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  100 
 
 		 65 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4705  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4470  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000641004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4305  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4316  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4682  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000635188  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4405  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4818  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0555  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000323504  hitchhiker  9.12848e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4689  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.93198e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4698  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000030404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3260  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000643202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3620  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 66 aa  62  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.18214  normal  0.947144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  55.36 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  51.79 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  53.7 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  57.14 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2217  ribosomal protein L35  50.88 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0577163 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11659  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1243  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143813  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0799  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  45.16 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50.79 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  46.15 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  47.27 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1771  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000608449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1737  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000617441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6086  50S ribosomal protein L35P  57.41 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  44.62 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  48.15 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  45.61 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21900  LSU ribosomal protein L35P  47.62 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.404594  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  48.28 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  49.23 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0661  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1162  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000825182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  48.15 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1382  ribosomal protein L35  61.4 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2140  ribosomal protein L35  53.57 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00205764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2065  50S ribosomal protein L35P  47.62 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.100679  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0994  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  48.15 
 
 		 65 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  52.94 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  42.59 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1278  50S ribosomal protein L35  44.83 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.503383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  51.85 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0924  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000127679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>