41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0661 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0661  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 67 aa  130  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0924  50S ribosomal protein L35  73.13 
 
 		 72 aa  98.2  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000127679  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1202  50S ribosomal protein L35  67.19 
 
 		 65 aa  87.4  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1254  50S ribosomal protein L35  64.06 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00450085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1677  ribosomal protein L35  50.82 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0163169  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0710  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2399  ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00298171  normal  0.367465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1317  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.660104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1302  50S ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.357951  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12260  LSU ribosomal protein L35P  43.55 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.162562  normal  0.135462 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1343  ribosomal protein L35  44.62 
 
 		 65 aa  43.5  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000164157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0223  50S ribosomal protein L35  40.62 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.0000237579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  45.9 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  49.18 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1268  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.35125 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  45 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3038  ribosomal protein L35  42.62 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.153889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1729  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00486125  hitchhiker  0.0014444 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 66 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  44.26 
 
 		 65 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  39.68 
 
 		 64 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3042  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  38.71 
 
 		 64 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  40.98 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1384  50S ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000768354  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 64 aa  40.8  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  43.33 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  44.44 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  41.27 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0561  hypothetical protein  45 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0100298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  36.07 
 
 		 66 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2041  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0828155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>