134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0470 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  66.2 
 
 
148 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.11 
 
 
216 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  63.51 
 
 
155 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  64.08 
 
 
148 aa  188  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.31 
 
 
154 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  60.14 
 
 
153 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.89 
 
 
154 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.44 
 
 
151 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.09 
 
 
156 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  57.93 
 
 
154 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  61.7 
 
 
147 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.58 
 
 
152 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  59.31 
 
 
155 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  56.34 
 
 
148 aa  168  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.23 
 
 
151 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.35 
 
 
151 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.38 
 
 
243 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.69 
 
 
197 aa  154  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  48.7 
 
 
161 aa  154  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.38 
 
 
158 aa  153  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50.34 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  49.3 
 
 
150 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  49.3 
 
 
150 aa  151  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.45 
 
 
198 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  40.45 
 
 
213 aa  149  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  46.9 
 
 
232 aa  147  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.1 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  50 
 
 
157 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.15 
 
 
202 aa  145  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.21 
 
 
182 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.18 
 
 
152 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  49.29 
 
 
176 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  49.29 
 
 
176 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.03 
 
 
224 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  45.03 
 
 
224 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  39.38 
 
 
246 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.43 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.39 
 
 
158 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.39 
 
 
158 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  48.48 
 
 
208 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  52.45 
 
 
151 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  50 
 
 
176 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.81 
 
 
269 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  44.2 
 
 
997 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  51.43 
 
 
181 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
241 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.11 
 
 
249 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.16 
 
 
987 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.04 
 
 
1011 aa  99.4  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.04 
 
 
1011 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.75 
 
 
983 aa  96.3  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  38.46 
 
 
991 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  39.67 
 
 
988 aa  92  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.95 
 
 
152 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000000688113  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.75 
 
 
1012 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  32.31 
 
 
1012 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  33.33 
 
 
980 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.39 
 
 
222 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.64 
 
 
229 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  33.87 
 
 
1019 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  34.48 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  31.08 
 
 
988 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.89 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.41 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  30.32 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.78 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.68 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.08 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.19 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  25.47 
 
 
1027 aa  65.1  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.43 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.75 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.68 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.78 
 
 
141 aa  62.8  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  27.92 
 
 
253 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2694  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.29 
 
 
153 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0998879  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5944  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.03 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.73 
 
 
212 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2642  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.7 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2660  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 
235 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2533  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.12 
 
 
235 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1016  hypothetical protein  26.12 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  27.33 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.52 
 
 
154 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.72 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0608  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.12 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.802203  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2442  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.12 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0851  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.12 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0856  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.12 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0056  carbon monoxide dehydrogenase family protein  26.12 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2003  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.19 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2613  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.19 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  27.33 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0685  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.19 
 
 
235 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.31708 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0678  hypothetical protein  26.8 
 
 
242 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.45 
 
 
241 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>