42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1710 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1020    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1353  hypothetical protein  49.8 
 
 
357 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.70759  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2170  hypothetical protein  42.16 
 
 
479 aa  233  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.663586  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0178  hypothetical protein  43.6 
 
 
421 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000132954  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2751  hypothetical protein  36.08 
 
 
469 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  37.01 
 
 
489 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  33.33 
 
 
484 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  34.48 
 
 
423 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  27.66 
 
 
630 aa  65.5  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  40.26 
 
 
444 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  30.77 
 
 
2272 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  36.7 
 
 
268 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  32.2 
 
 
2179 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  35.56 
 
 
928 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  22.35 
 
 
3472 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  22.35 
 
 
3471 aa  55.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0722  hypothetical protein  44.16 
 
 
148 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  31.71 
 
 
926 aa  53.5  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  23.38 
 
 
3521 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0155  hypothetical protein  39.34 
 
 
424 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.694337  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0549  hypothetical protein  36.53 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  27.85 
 
 
3333 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.98 
 
 
3409 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.36 
 
 
261 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  24.46 
 
 
2353 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  38.89 
 
 
602 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3030  hypothetical protein  33.78 
 
 
139 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.702379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2110  hypothetical protein  33.78 
 
 
139 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.237368  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0802  hypothetical protein  33.78 
 
 
139 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.730574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1978  hypothetical protein  33.78 
 
 
139 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  41.86 
 
 
555 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1243  hypothetical protein  36.23 
 
 
150 aa  47.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0770196  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  36.27 
 
 
489 aa  47  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2634  hypothetical protein  33.78 
 
 
124 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3064  hypothetical protein  33.78 
 
 
124 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  29.79 
 
 
778 aa  47  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0658  hypothetical protein  37.88 
 
 
103 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37597  normal  0.653833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1572  hypothetical protein  33.78 
 
 
124 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3332  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3892  hypothetical protein  37.31 
 
 
349 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219205  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5019  putative lipoprotein  37.97 
 
 
106 aa  43.9  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0701356  normal  0.0646806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.56 
 
 
2313 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>