55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0790 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
242 aa  482  1e-135  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  35.91 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  30.77 
 
 
237 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  31.36 
 
 
236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  32.89 
 
 
248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  31.9 
 
 
248 aa  112  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  33.91 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  34.6 
 
 
242 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  29.79 
 
 
235 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  29.36 
 
 
235 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  28 
 
 
241 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  29.36 
 
 
235 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  31.22 
 
 
249 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  29.73 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  26.32 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  27.11 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  27.43 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  25.82 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  27.23 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  28.39 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  25 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  26.18 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  24.78 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  25.35 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  29 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  25 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  27.83 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  27.55 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  24.56 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  28.11 
 
 
257 aa  69.7  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  26.96 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  26.96 
 
 
276 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  24.77 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  26.92 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  26.79 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  24.12 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  25.1 
 
 
251 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  24.69 
 
 
274 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  25.76 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  25.38 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  25.38 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  26.04 
 
 
274 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  27.07 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  25 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  22.91 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  28.63 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  26.99 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  26.48 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  26.43 
 
 
256 aa  48.9  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  25 
 
 
226 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  24.57 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4768  protein of unknown function DUF75  25.49 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2273  hypothetical protein  21.72 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>