29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4032 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4032  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  782    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0132439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4246  hypothetical protein  40.05 
 
 		 393 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4134  hypothetical protein  40.05 
 
 		 393 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05318  hypothetical protein  39.69 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0339389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3387  hypothetical protein  40.58 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4114  hypothetical protein  40.85 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1750  hypothetical protein  40.16 
 
 		 391 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.130488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5228  hypothetical protein  38.24 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34403  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0645  hypothetical protein  38.34 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4090  hypothetical protein  35.47 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4401  hypothetical protein  32.2 
 
 		 393 aa  177  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.366288 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4284  hypothetical protein  34.82 
 
 		 389 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2228  hypothetical protein  34.05 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207313  normal  0.171513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1779  hypothetical protein  32.29 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00148709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3149  hypothetical protein  31.54 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2768  hypothetical protein  31.66 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4981  hypothetical protein  30.83 
 
 		 395 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000297045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2362  hypothetical protein  33.21 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4294  hypothetical protein  28.64 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4340  hypothetical protein  25.86 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5504  hypothetical protein  28.21 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4921  hypothetical protein  27.75 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.640656  normal  0.943138 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6002  hypothetical protein  25.92 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4149  hypothetical protein  29.21 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359659  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4941  hypothetical protein  30.43 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352373  normal  0.303567 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2791  hypothetical protein  27.63 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3189  hypothetical protein  27.63 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0746  hypothetical protein  24.15 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1584  ATPase  29.55 
 
 		 356 aa  47  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>