More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0051 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
128 aa  260  4.999999999999999e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  60.16 
 
 
128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
128 aa  160  6e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 
128 aa  156  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  153  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
128 aa  148  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
128 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  56.91 
 
 
130 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  56.91 
 
 
133 aa  147  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
129 aa  147  6e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 
130 aa  147  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  56.69 
 
 
129 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  55.28 
 
 
132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  55.65 
 
 
129 aa  144  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  53.12 
 
 
128 aa  144  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
161 aa  142  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
161 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
129 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
161 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
161 aa  140  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
162 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 
162 aa  140  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
159 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  58.54 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  54.4 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  56.91 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
159 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
158 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  136  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  51.15 
 
 
131 aa  135  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
128 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  52.85 
 
 
165 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
161 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
164 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  134  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
166 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
128 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  52.8 
 
 
174 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  54.47 
 
 
131 aa  133  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  54.47 
 
 
162 aa  131  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  50.82 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
171 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  54.47 
 
 
131 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  131  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  54.47 
 
 
131 aa  131  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  51.22 
 
 
131 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  50.41 
 
 
130 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  48.82 
 
 
130 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
160 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>