More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_05461 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  100 
 
 		 383 aa  767    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  87.99 
 
 		 362 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  87.99 
 
 		 362 aa  586  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  79.11 
 
 		 357 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  55.88 
 
 		 379 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  56.03 
 
 		 372 aa  421  1e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  55.23 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  56.3 
 
 		 384 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  52.79 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  52.55 
 
 		 378 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  51.32 
 
 		 344 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  51.6 
 
 		 382 aa  352  5.9999999999999994e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  41.8 
 
 		 349 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  63.18 
 
 		 366 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  62.63 
 
 		 349 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  42.06 
 
 		 346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  63.24 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  63.73 
 
 		 373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  41.8 
 
 		 346 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  63.86 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  61.5 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  62.63 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  53.17 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  49.29 
 
 		 341 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  45.74 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  32.38 
 
 		 332 aa  210  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  33.6 
 
 		 354 aa  209  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.64 
 
 		 355 aa  207  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.85 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  31.85 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.68 
 
 		 365 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.41 
 
 		 343 aa  203  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  34.91 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.36 
 
 		 367 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  32.46 
 
 		 350 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  31.78 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.98 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  42.54 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  42.54 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.77 
 
 		 374 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  32.19 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  31.15 
 
 		 361 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  34.13 
 
 		 393 aa  196  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  40.95 
 
 		 323 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  34.21 
 
 		 363 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  31.5 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.23 
 
 		 345 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.98 
 
 		 353 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  41.44 
 
 		 320 aa  193  5e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  45.23 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  40.79 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  45.73 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42.93 
 
 		 460 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  43.88 
 
 		 493 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  45.45 
 
 		 326 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.71 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  39.91 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.62 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  40.87 
 
 		 323 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  44.72 
 
 		 335 aa  189  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  42.54 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  41.71 
 
 		 460 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  43.72 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  41.58 
 
 		 449 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  41.71 
 
 		 452 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  41.58 
 
 		 449 aa  186  7e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  43.78 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  41.71 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  42.21 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  44.67 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  44.28 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  44.67 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  33.77 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  33.07 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  30.69 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  29.61 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  28.08 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  28.08 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.05 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  30.73 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  26.64 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  35.02 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  26.24 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  38.7 
 
 		 324 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  38.26 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  33.57 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  26.74 
 
 		 406 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  27.6 
 
 		 373 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  27.08 
 
 		 408 aa  169  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  28.57 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  27.87 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  29.53 
 
 		 401 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  27.09 
 
 		 376 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  37.1 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2216  cobalamin synthesis protein P47K  26.7 
 
 		 448 aa  167  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  32.64 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  32.46 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  34.69 
 
 		 407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  40.36 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.49 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>