More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3967 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  97.01 
 
 
201 aa  359  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  92.54 
 
 
201 aa  346  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  70.86 
 
 
200 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  59.7 
 
 
214 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  59.78 
 
 
201 aa  214  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  59.22 
 
 
223 aa  212  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  55.14 
 
 
201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  58.33 
 
 
201 aa  211  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  55.75 
 
 
186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  54.12 
 
 
195 aa  210  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  55.19 
 
 
201 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  55.98 
 
 
196 aa  209  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  55.93 
 
 
197 aa  188  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  55.37 
 
 
197 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  48.28 
 
 
187 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  48.73 
 
 
198 aa  178  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  51.72 
 
 
182 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  49.15 
 
 
182 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  47.19 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  48.21 
 
 
182 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  46.89 
 
 
183 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  47.19 
 
 
183 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  50.29 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  50 
 
 
183 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  46.89 
 
 
187 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  46.29 
 
 
188 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  44.19 
 
 
177 aa  155  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  44.16 
 
 
186 aa  154  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  44.89 
 
 
219 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  42.11 
 
 
182 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  42.51 
 
 
195 aa  144  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  40.91 
 
 
184 aa  144  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  45.76 
 
 
186 aa  143  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  44.77 
 
 
181 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  42.77 
 
 
196 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  42.7 
 
 
182 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  42.2 
 
 
175 aa  141  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  46.24 
 
 
180 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  41.28 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  38.73 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  46.24 
 
 
181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  42.39 
 
 
180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  45.93 
 
 
183 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  40.46 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  39.2 
 
 
187 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  43.02 
 
 
190 aa  138  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  43.65 
 
 
204 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  43.08 
 
 
209 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  43.75 
 
 
187 aa  136  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  45.18 
 
 
195 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  45.14 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  44.83 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1960  hypothetical protein  37.82 
 
 
196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  38.8 
 
 
189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  40.57 
 
 
191 aa  135  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  41.4 
 
 
182 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  42.69 
 
 
181 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  43.43 
 
 
212 aa  135  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  41.4 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  40.61 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  37.44 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  41.05 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  38.15 
 
 
177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  38.78 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  46.67 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  40.72 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  40.78 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  40.78 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  40.78 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  38.15 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  43.03 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  44.07 
 
 
201 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  38.64 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  43.6 
 
 
237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  39.77 
 
 
175 aa  128  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  42.86 
 
 
185 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  43.02 
 
 
237 aa  127  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  41.71 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0518  YceI family protein  44.19 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000120674  hitchhiker  0.000476131 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  39.43 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  40.68 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  38.97 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  43.35 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  38.51 
 
 
181 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  38.22 
 
 
199 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  43.86 
 
 
254 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  41.18 
 
 
285 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  37.14 
 
 
179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  40.41 
 
 
189 aa  125  6e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  42.29 
 
 
181 aa  124  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  36.68 
 
 
190 aa  124  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  37.13 
 
 
193 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  40.57 
 
 
176 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  38.62 
 
 
189 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  41.04 
 
 
182 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  40.8 
 
 
205 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  35.94 
 
 
189 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  41.95 
 
 
187 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  38.46 
 
 
197 aa  121  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>