225 genes were found for organism Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mmcs_5414  CDS  NC_008147  400  666  267  hypothetical protein  YP_642570  normal  0.0319708  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5415  CDS  NC_008147  725  1264  540  hypothetical protein  YP_642571  hitchhiker  0.001133  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5416  CDS  NC_008147  1465  1722  258  hypothetical protein  YP_642572  hitchhiker  8.74387e-07  normal  0.640485  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5417  CDS  NC_008147  1843  2322  480  hypothetical protein  YP_642573  hitchhiker  1.18498e-07  normal  0.437912  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5418  CDS  NC_008147  2319  2579  261  hypothetical protein  YP_642574  hitchhiker  6.41756e-09  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5419  CDS  NC_008147  2823  3200  378  hypothetical protein  YP_642575  hitchhiker  3.31071e-08  normal  0.80252  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5420  CDS  NC_008147  3202  3876  675  hypothetical protein  YP_642576  hitchhiker  6.77769e-08  normal  0.66486  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5421  CDS  NC_008147  4303  4719  417  hypothetical protein  YP_642577  hitchhiker  3.52324e-07  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5422  CDS  NC_008147  4844  5713  870  hypothetical protein  YP_642578  hitchhiker  0.000135701  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5423  CDS  NC_008147  6078  6827  750  hypothetical protein  YP_642579  hitchhiker  0.000397261  normal  0.815188  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5424  CDS  NC_008147  6824  7477  654  hypothetical protein  YP_642580  normal  0.0433333  normal  0.616063  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5425  CDS  NC_008147  7532  9223  1692  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase  YP_642581  normal  normal  0.408146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5426  CDS  NC_008147  9367  9669  303  hypothetical protein  YP_642582  normal  normal  0.705268  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5427  CDS  NC_008147  9670  9984  315  hypothetical protein  YP_642583  normal  normal  0.642999  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5428  CDS  NC_008147  10066  11514  1449  TnpC protein  YP_642584  normal  normal  0.572731  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5429  CDS  NC_008147  11649  11984  336  hypothetical protein  YP_642585  normal  normal  0.308661  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5430  CDS  NC_008147  11965  13209  1245  integrase catalytic subunit  YP_642586  normal  normal  0.270049  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5431  CDS  NC_008147  13254  14084  831  putative transposase for insertion element IS6110 (second part)  YP_642587  normal  normal  0.15452  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5432  CDS  NC_008147  14087  14452  366  transposase IS3/IS911  YP_642588  normal  normal  0.115544  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5433  CDS  NC_008147  14567  15886  1320  transposase, mutator type  YP_642589  normal  normal  0.0965425  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5434  CDS  NC_008147  16264  16623  360  hypothetical protein  YP_642590  normal  normal  0.339133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5435  CDS  NC_008147  16640  17389  750  IclR family transcriptional regulator  YP_642591  normal  normal  0.517409  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5436  CDS  NC_008147  17428  18252  825  4-oxalocrotonate decarboxylase  YP_642592  normal  normal  0.635895  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5437  CDS  NC_008147  18249  19196  948  acetaldehyde dehydrogenase  YP_642593  normal  normal  0.747247  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5438  CDS  NC_008147  19193  20242  1050  4-hydroxy-2-ketovalerate aldolase  YP_642594  normal  0.113513  normal  0.601738  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5439  CDS  NC_008147  20478  20771  294  hypothetical protein  YP_642595  normal  0.26663  normal  0.419299  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5440  CDS  NC_008147  20985  21884  900  alpha/beta hydrolase fold  YP_642596  normal  normal  0.341918  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5441  CDS  NC_008147  21884  23200  1317  Rieske (2Fe-2S) region  YP_642597  normal  0.0352555  normal  0.90702  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5442  CDS  NC_008147  23203  23715  513  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_642598  normal  0.843649  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5443  CDS  NC_008147  23755  24984  1230  oxidoreductase-like protein  YP_642599  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5444  CDS  NC_008147  25004  25972  969  extradiol ring-cleavage dioxygenase III subunit B  YP_642600  normal  normal  0.801471  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5445  CDS  NC_008147  26356  27321  966  class II aldolase/adducin-like protein  YP_642601  normal  normal  0.618582  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5446  CDS  NC_008147  27426  28085  660  MarR family transcriptional regulator  YP_642602  normal  normal  0.668367  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5447  CDS  NC_008147  28156  29019  864  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  YP_642603  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5448  CDS  NC_008147  29129  29572  444  cupin 2, barrel  YP_642604  normal  0.708388  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5449  CDS  NC_008147  29673  30230  558  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  YP_642605  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5450  CDS  NC_008147  30227  31642  1416  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  YP_642606  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5451  CDS  NC_008147  31890  32087  198  hypothetical protein  YP_642607  normal  0.183925  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5452  CDS  NC_008147  32118  33164  1047  hypothetical protein  YP_642608  normal  0.080026  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5453  CDS  NC_008147  33151  33609  459  hypothetical protein  YP_642609  normal  0.0654575  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5454  CDS  NC_008147  33646  34812  1167  putative nonspecific lipid-transfer protein  YP_642610  normal  0.839799  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5455  CDS  NC_008147  34809  36062  1254  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  YP_642611  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5456  CDS  NC_008147  36115  37146  1032  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  YP_642612  normal  0.077084  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5457  CDS  NC_008147  37253  37795  543  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  YP_642613  normal  0.164011  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5458  CDS  NC_008147  37792  39135  1344  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  YP_642614  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5459  CDS  NC_008147  39441  40760  1320  transposase, mutator type  YP_642615  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5460  CDS  NC_008147  40922  41401  480  MarR family transcriptional regulator  YP_642616  normal  0.599234  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5461  CDS  NC_008147  41391  42602  1212  major facilitator transporter  YP_642617  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5462  CDS  NC_008147  42637  42888  252  hypothetical protein  YP_642618  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5463  CDS  NC_008147  42928  43266  339  hypothetical protein  YP_642619  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5464  CDS  NC_008147  43300  44043  744  hypothetical protein  YP_642620  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5465  CDS  NC_008147  44160  45035  876  hypothetical protein  YP_642621  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5466  CDS  NC_008147  45036  45647  612  hypothetical protein  YP_642622  normal  0.615216  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5467  CDS  NC_008147  45881  46414  534  hypothetical protein  YP_642623  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5468  CDS  NC_008147  46761  47012  252  hypothetical protein  YP_642624  normal  0.795539  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5469  CDS  NC_008147  47022  48368  1347  replicative DNA helicase  YP_642625  normal  0.430835  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5470  CDS  NC_008147  48435  49229  795  hypothetical protein  YP_642626  normal  0.0836977  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5471  CDS  NC_008147  50313  50660  348  hypothetical protein  YP_642627  normal  0.419177  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5472  CDS  NC_008147  50657  51340  684  hypothetical protein  YP_642628  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5473  CDS  NC_008147  51337  51963  627  hypothetical protein  YP_642629  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5474  CDS  NC_008147  51998  52879  882  hypothetical protein  YP_642630  normal  0.602004  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5475  CDS  NC_008147  52876  53340  465  transcription factor WhiB  YP_642631  normal  0.732473  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5476  CDS  NC_008147  53337  53963  627  hypothetical protein  YP_642632  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5477  CDS  NC_008147  53960  54292  333  transcription factor WhiB  YP_642633  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5478  CDS  NC_008147  54289  54825  537  hypothetical protein  YP_642634  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5479  CDS  NC_008147  54855  55124  270  hypothetical protein  YP_642635  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5480  CDS  NC_008147  55369  56100  732  hypothetical protein  YP_642636  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5481  CDS  NC_008147  56197  56682  486  XRE family transcriptional regulator  YP_642637  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5482  CDS  NC_008147  57097  57678  582  DNA polymerase III, epsilon subunit  YP_642638  normal  normal  0.915048  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5483  CDS  NC_008147  57743  58051  309  hypothetical protein  YP_642639  normal  normal  0.629944  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5484  CDS  NC_008147  58048  58740  693  hypothetical protein  YP_642640  normal  normal  0.671648  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5485  CDS  NC_008147  59245  59529  285  prevent-host-death protein  YP_642641  normal  normal  0.822453  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5486  CDS  NC_008147  59526  59783  258  addiction module toxin, Txe/YoeB  YP_642642  normal  normal  0.617612  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5487  CDS  NC_008147  59814  60509  696  hypothetical protein  YP_642643  normal  normal  0.486353  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5488  CDS  NC_008147  60506  62269  1764  hypothetical protein  YP_642644  normal  normal  0.438418  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5489  CDS  NC_008147  62363  63046  684  hypothetical protein  YP_642645  normal  normal  0.375456  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5490  CDS  NC_008147  63313  63780  468  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  YP_642646  normal  normal  0.098913  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5491  CDS  NC_008147  63789  66797  3009  AAA family ATPase  YP_642647  normal  normal  0.188779  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5492  CDS  NC_008147  66838  69573  2736  adenine-specific DNA methylase  YP_642648  normal  0.219644  normal  0.117593  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5493  CDS  NC_008147  69570  72779  3210  helicase-like protein  YP_642649  normal  normal  0.0695829  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5494  CDS  NC_008147  72985  73437  453  hypothetical protein  YP_642650  normal  normal  0.128052  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5495  CDS  NC_008147  73494  73895  402  hypothetical protein  YP_642651  normal  normal  0.124958  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5496  CDS  NC_008147  73914  74264  351  hypothetical protein  YP_642652  normal  normal  0.193026  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5497  CDS  NC_008147  74613  75452  840  hypothetical protein  YP_642653  normal  normal  0.237549  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5498  CDS  NC_008147  76042  77361  1320  hypothetical protein  YP_642654  normal  normal  0.539423  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5499  CDS  NC_008147  77393  77707  315  hypothetical protein  YP_642655  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5500  CDS  NC_008147  77772  78095  324  hypothetical protein  YP_642656  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5501  CDS  NC_008147  78160  78423  264  hypothetical protein  YP_642657  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5502  CDS  NC_008147  78427  78846  420  PilT protein-like protein  YP_642658  normal  normal  0.835237  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5503  CDS  NC_008147  78923  79399  477  hypothetical protein  YP_642659  normal  normal  0.848505  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5504  CDS  NC_008147  79417  79848  432  hypothetical protein  YP_642660  normal  0.480295  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5505  CDS  NC_008147  79936  81360  1425  integrase catalytic subunit  YP_642661  normal  0.334264  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5506  CDS  NC_008147  81459  82379  921  phosphoserine phosphatase SerB  YP_642662  normal  0.933575  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5507  CDS  NC_008147  82392  83036  645  hypothetical protein  YP_642663  normal  0.58587  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5508  CDS  NC_008147  83033  83356  324  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  YP_642664  normal  0.466643  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5509  CDS  NC_008147  83353  83589  237  hypothetical protein  YP_642665  normal  0.387064  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5510  CDS  NC_008147  83662  83976  315  hypothetical protein  YP_642666  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5511  CDS  NC_008147  84087  84461  375  hypothetical protein  YP_642667  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5512  CDS  NC_008147  84463  85050  588  hypothetical protein  YP_642668  normal  0.781038  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Mmcs_5513  CDS  NC_008147  85070  87541  2472  hypothetical protein  YP_642669  normal  normal  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>