11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5434 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5434  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  245  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.339133 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5831  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  245  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.954343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1639  integrase catalytic subunit  67.31 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0665  integrase catalytic subunit  67.31 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0380  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0741  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1404  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0981822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1895  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.571703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4080  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4235  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4622  Integrase catalytic region  54.55 
 
 
317 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0989982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>