58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5475 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5475  transcription factor WhiB  100 
 
 		 154 aa  320  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.732473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5875  transcription factor WhiB  100 
 
 		 133 aa  275  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4685  transcription factor WhiB  54 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.067273  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1782  transcription factor WhiB  54 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554271  normal  0.754693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  49.06 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  52 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  52 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  52 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  52 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  46.97 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  57.5 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  50 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  55 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  46.3 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  49.09 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  59.09 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1412  transcription factor WhiB  51.16 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  56.41 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  50 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30700  transcription factor WhiB  43.86 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.588059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  56.82 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  32.69 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  56.41 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  50 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3951  transcription factor WhiB  43.08 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.152162 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  56.41 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  48.08 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  46.94 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07590  Transcription factor WhiB  32.53 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.882581  normal  0.470516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0636  transcription factor WhiB  58.33 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2328  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  53.85 
 
 		 82 aa  43.9  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5364  transcription factor WhiB  55.26 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08450  transcription factor WhiB  45.65 
 
 		 82 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1439  normal  0.293048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4914  transcription factor WhiB  38.36 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2428  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0248612 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2908  transcription factor WhiB  45.65 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.224959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2697  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0861616  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  40 
 
 		 103 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1303  transcription factor WhiB  42.42 
 
 		 118 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00139709  normal  0.234625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7711  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 83 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  47.83 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12870  Transcription factor WhiB  42 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  53.85 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4450  transcription factor WhiB  50 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2588  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.536845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  44.23 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0737  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.239855  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  45.45 
 
 		 92 aa  41.2  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1162  transcription factor WhiB  52.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1179  transcription factor WhiB  52.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1189  transcription factor WhiB  52.78 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27842  normal  0.105428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4138  transcription factor WhiB  51.22 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000204741  hitchhiker  0.000082655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1209  transcription factor WhiB  50 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3795  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.335539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1877  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0694985  normal  0.908657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5441  transcription factor WhiB  28.09 
 
 		 118 aa  40.4  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>