33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2382 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  312  8e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  39.46 
 
 
143 aa  100  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  42.74 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  41.58 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  41.24 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  39.18 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  32.52 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  32.32 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  40.21 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  31.78 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  40.21 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  40.21 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  37.76 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  38.78 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  38.78 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  33.59 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  39.58 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  40.86 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  38.54 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  31.25 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  36.73 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  38.95 
 
 
194 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  27.21 
 
 
166 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  35.42 
 
 
168 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  31.54 
 
 
179 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  35.71 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  36.73 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  32.65 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  25.74 
 
 
166 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  31.78 
 
 
171 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  29.45 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  30 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2765  hypothetical protein  36.17 
 
 
217 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.909411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>