34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4098 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  344  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  85.06 
 
 
174 aa  280  6.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  81.61 
 
 
174 aa  259  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  48.81 
 
 
173 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  48.02 
 
 
183 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  46.99 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  46.99 
 
 
177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  46.39 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  50 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  48.7 
 
 
182 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  45.16 
 
 
182 aa  124  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  46.75 
 
 
182 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  45.39 
 
 
182 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  46.71 
 
 
182 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  45.39 
 
 
182 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  49.35 
 
 
194 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  46.67 
 
 
184 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  42.01 
 
 
170 aa  121  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  40.57 
 
 
180 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  43.87 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  39.43 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  42.38 
 
 
168 aa  111  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  35.06 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  36.26 
 
 
166 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  36.26 
 
 
166 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  49.04 
 
 
139 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  44.83 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  48.08 
 
 
139 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  28.93 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  32.32 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  28.82 
 
 
186 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  28.15 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2765  hypothetical protein  30.38 
 
 
217 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.909411  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  27.21 
 
 
143 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>