33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1409 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  100 
 
 
182 aa  350  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  100 
 
 
182 aa  350  5.9999999999999994e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  96.7 
 
 
182 aa  317  5e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  87.36 
 
 
182 aa  288  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  86.81 
 
 
182 aa  285  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  89.87 
 
 
179 aa  277  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  90.32 
 
 
182 aa  268  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  65.9 
 
 
179 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  64.94 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  62.82 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  58.19 
 
 
177 aa  178  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  59.55 
 
 
177 aa  177  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  61.25 
 
 
177 aa  175  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  61.94 
 
 
184 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  58.44 
 
 
194 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  47.53 
 
 
168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  48.72 
 
 
166 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  44.83 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  47.44 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  48.82 
 
 
174 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  45.24 
 
 
174 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  43.33 
 
 
171 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  44.64 
 
 
174 aa  124  9e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  53.51 
 
 
165 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  43.21 
 
 
183 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  39.31 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  50.96 
 
 
139 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  49.04 
 
 
139 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  40.21 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  31.21 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  32.73 
 
 
173 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  33 
 
 
143 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  32 
 
 
143 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>