33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0449 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  362  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  81.11 
 
 
179 aa  289  1e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  68.83 
 
 
182 aa  207  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  68.83 
 
 
182 aa  207  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  70.13 
 
 
182 aa  206  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  67.97 
 
 
182 aa  206  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  68.59 
 
 
182 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  67.74 
 
 
179 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  66.88 
 
 
182 aa  201  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  60.39 
 
 
178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  53.01 
 
 
177 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  51.79 
 
 
177 aa  165  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  53.5 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  51.81 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  49.07 
 
 
168 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  51.88 
 
 
194 aa  149  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  50.66 
 
 
166 aa  141  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  50.66 
 
 
166 aa  140  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  45.22 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  43.53 
 
 
174 aa  124  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  42.94 
 
 
174 aa  123  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  43.95 
 
 
170 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  40.91 
 
 
173 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  40.57 
 
 
174 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  52.94 
 
 
165 aa  119  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  39.46 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  46.15 
 
 
139 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  46.15 
 
 
139 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  33.59 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  28.85 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  32.38 
 
 
143 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>