34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2209 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  348  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  92.09 
 
 
177 aa  301  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  90.4 
 
 
177 aa  288  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  69.43 
 
 
184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  66.88 
 
 
178 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  63.46 
 
 
179 aa  187  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  62.5 
 
 
182 aa  184  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  62.5 
 
 
182 aa  184  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  62.26 
 
 
182 aa  184  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  61.54 
 
 
182 aa  184  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  59.75 
 
 
182 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  62.82 
 
 
182 aa  177  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  56.35 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  53.63 
 
 
179 aa  170  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  53.8 
 
 
180 aa  167  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  56.02 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  53.75 
 
 
168 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  54.82 
 
 
166 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  46.99 
 
 
174 aa  141  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  47.31 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  46.39 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  45.78 
 
 
174 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  44.03 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  39.2 
 
 
173 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  57.98 
 
 
165 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  38.42 
 
 
171 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  48.78 
 
 
139 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  49.19 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  31.79 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  32.37 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  36.73 
 
 
152 aa  58.9  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  35.79 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  35.79 
 
 
143 aa  55.1  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2765  hypothetical protein  33.58 
 
 
217 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.909411  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>