33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3938 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  359  9e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  31.79 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  28.93 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  27.5 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  30 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  37.61 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  32.47 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  34.58 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  34.19 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  27.45 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  32.2 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  33.03 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  35.51 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  30.97 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  30.97 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  34.58 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  29.19 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  32.62 
 
 
166 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  37.25 
 
 
165 aa  60.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  30.63 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  32.73 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  32.73 
 
 
182 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  33.64 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  28.85 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  36.36 
 
 
194 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  29.73 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  27.65 
 
 
186 aa  57.4  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  25.79 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  25.71 
 
 
168 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  25.47 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  23.15 
 
 
143 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>