34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2933 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  276  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  90.65 
 
 		 139 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  60.38 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  48.67 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  52.88 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  49.18 
 
 		 182 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  51.92 
 
 		 183 aa  107  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  46.77 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  53.85 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  51.92 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  50.96 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  50.96 
 
 		 182 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  52.88 
 
 		 177 aa  103  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  52.88 
 
 		 177 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  53.33 
 
 		 194 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  50.96 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  46.15 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  46.4 
 
 		 179 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  46.77 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  45.97 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  45.9 
 
 		 170 aa  97.8  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  53.4 
 
 		 184 aa  97.4  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  97.4  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  49.04 
 
 		 174 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  49.04 
 
 		 178 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  45.54 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  49.04 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  49.04 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  39.5 
 
 		 186 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  32.2 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  32.65 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  29.91 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  30.85 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2765  hypothetical protein  31.93 
 
 		 217 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.909411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>