33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2844 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  347  6e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  66.46 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  62.15 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  63.35 
 
 		 182 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  59.06 
 
 		 180 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  61.33 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  63.64 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  62.11 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  62.11 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  61.33 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  61.25 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  64.1 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  62.66 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  63.12 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  55.68 
 
 		 194 aa  164  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  51.95 
 
 		 168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  47.49 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  46.37 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  44.94 
 
 		 170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  45.45 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  56.03 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  43.2 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  40.12 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  42.48 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  42.6 
 
 		 174 aa  111  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  43.53 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  49.04 
 
 		 139 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  49.04 
 
 		 139 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  38.54 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  30.63 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  41.86 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  34.02 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  34.02 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>