33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4499 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  328  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  95.18 
 
 
166 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  52.1 
 
 
168 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  54.22 
 
 
177 aa  158  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  56.02 
 
 
177 aa  157  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  54.82 
 
 
177 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  52.2 
 
 
184 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  50.66 
 
 
180 aa  140  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  52.32 
 
 
179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  52.6 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  51.32 
 
 
182 aa  137  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  50.32 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  46.11 
 
 
170 aa  132  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  47.44 
 
 
182 aa  131  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  47.44 
 
 
182 aa  131  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  48.68 
 
 
182 aa  131  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  47.44 
 
 
182 aa  130  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  47.44 
 
 
179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  48.68 
 
 
182 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  55.56 
 
 
165 aa  122  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  36.57 
 
 
173 aa  111  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  38.95 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  39.87 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  36.26 
 
 
174 aa  104  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  36.84 
 
 
174 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  45.97 
 
 
139 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  48.6 
 
 
139 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  35.67 
 
 
174 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  27.21 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  32.62 
 
 
173 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  39.51 
 
 
186 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  31.73 
 
 
143 aa  54.3  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  31.73 
 
 
143 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>