33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2335 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  351  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  96.7 
 
 		 182 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  96.7 
 
 		 182 aa  317  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  87.36 
 
 		 182 aa  285  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  86.81 
 
 		 182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  89.87 
 
 		 179 aa  275  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  89.68 
 
 		 182 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  65.32 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  64.77 
 
 		 180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  64.1 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  59.32 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  59.55 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  61.25 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  59.74 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  59.09 
 
 		 194 aa  160  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  48.77 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  51.32 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  51.32 
 
 		 166 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  45.4 
 
 		 173 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  49.11 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  45.24 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  44 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  45.88 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  43.83 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  54.39 
 
 		 165 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  38.95 
 
 		 170 aa  118  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  46.77 
 
 		 139 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  48.28 
 
 		 139 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  40.21 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  30.97 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  40.74 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  33 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  32 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>