33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0528 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  56.25 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  57.95 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  55.25 
 
 
177 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  57.86 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  59.09 
 
 
182 aa  161  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  58.44 
 
 
182 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  58.44 
 
 
182 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  58.44 
 
 
182 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  58.75 
 
 
178 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  58.44 
 
 
179 aa  157  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  59.74 
 
 
184 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  59.09 
 
 
182 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  51.88 
 
 
180 aa  149  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  50.33 
 
 
168 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  53.95 
 
 
179 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  52.6 
 
 
166 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  51.61 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  49.35 
 
 
174 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  49.35 
 
 
174 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  44.17 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  55.3 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  41.57 
 
 
171 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  37.31 
 
 
183 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  44.44 
 
 
170 aa  111  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  46.75 
 
 
174 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  54.81 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  53.33 
 
 
139 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  34.52 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  38.95 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  36.36 
 
 
173 aa  58.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>