34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0672 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  357  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2379  hypothetical protein  65.57 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.238057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0964  hypothetical protein  66.12 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2209  hypothetical protein  65.76 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1176  putative secreted protein  64.52 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2844  hypothetical protein  64.94 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3413  hypothetical protein  62.09 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17107  normal  0.0884418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1409  putative secreted protein  61.94 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.908606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1275  putative secreted protein  61.94 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.10999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2335  hypothetical protein  59.74 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000890552  unclonable  0.00000020611 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1196  hypothetical protein  62.09 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4168  hypothetical protein  61.15 
 
 		 182 aa  165  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199359  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1639  hypothetical protein  57.96 
 
 		 179 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0449  hypothetical protein  53.5 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0528  hypothetical protein  58.75 
 
 		 194 aa  157  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1455  hypothetical protein  52.56 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4499  hypothetical protein  50.29 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59670  hypothetical protein  50.29 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000130336  decreased coverage  5.0273199999999993e-20 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1750  hypothetical protein  47.47 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0324  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  127  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14370  hypothetical protein  57.26 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0742842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4098  hypothetical protein  46.67 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4181  hypothetical protein  46 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0643  hypothetical protein  43.04 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3011  hypothetical protein  51.4 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3719  hypothetical protein  41.83 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3304  hypothetical protein  53.4 
 
 		 139 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2933  hypothetical protein  53.4 
 
 		 139 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3938  hypothetical protein  34.19 
 
 		 173 aa  67.8  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.445504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2382  hypothetical protein  31.78 
 
 		 152 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0631  hypothetical protein  33.54 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1032  hypothetical protein  33.03 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1070  hypothetical protein  33.03 
 
 		 143 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2765  hypothetical protein  34.53 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.909411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>