70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0647 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0647  peptidoglycan hydrolase  100 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0219  peptidoglycan hydrolase  97.94 
 
 		 97 aa  192  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3363  rod binding protein-like protein  51.28 
 
 		 99 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0271  lateral flagellar peptidoglycan hydrolase LfgJ  50 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.697145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 374 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000732  flagellar protein FlgJ  57.14 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  46.84 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04917  putative flagellar protein FlgJ  54.29 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  46.48 
 
 		 316 aa  71.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0061  peptidoglycan hydrolase  43.06 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0067  peptidoglycan hydrolase  40.24 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3643  peptidoglycan hydrolase  36.56 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40 
 
 		 328 aa  57.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  39.73 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  41.82 
 
 		 269 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3963  peptidoglycan hydrolase  34.78 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  42.47 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3570  putative flagellar protein FlgJ  35.71 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  40.54 
 
 		 414 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.11 
 
 		 388 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3460  peptidoglycan hydrolase  31.91 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.72 
 
 		 384 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.72 
 
 		 384 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  42.25 
 
 		 416 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.72 
 
 		 384 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  42.86 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2330  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.8 
 
 		 332 aa  50.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30 
 
 		 394 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004165  flagellar protein FlgJ  34.21 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01295  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.89 
 
 		 308 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4679  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2237  peptidoglycan hydrolase  34.69 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 		 291 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2310  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.88 
 
 		 372 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.94 
 
 		 430 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1348  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 363 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3079  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 337 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1466  flagellar biosynthesis  35.62 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.18 
 
 		 290 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1353  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 341 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1329  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 		 389 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0311212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2589  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 		 385 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1232  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 291 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3241  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 		 384 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1329  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  38.57 
 
 		 350 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1605  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.43 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.202328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1267  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 		 384 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1337  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 		 384 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.75524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.94 
 
 		 400 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.94 
 
 		 400 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1424  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 380 aa  43.5  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 367 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2954  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 380 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3092  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 380 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2939  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 		 380 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1169  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.43 
 
 		 377 aa  42.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0546909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  30.67 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0245  peptidoglycan hydrolase  34.33 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24080  flagellar rod assembly protein/muramidase  37.33 
 
 		 325 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.337249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1561  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.67 
 
 		 317 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.650654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0192  peptidoglycan hydrolase  34.33 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.628874  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2915  peptidoglycan hydrolase  37.5 
 
 		 105 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2417  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.51 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.112491  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0512  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.88 
 
 		 328 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2316  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.51 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2006  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.51 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 		 348 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1533  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.05 
 
 		 325 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  37.14 
 
 		 340 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>