36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0192 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0192  peptidoglycan hydrolase  100 
 
 
121 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.628874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0245  peptidoglycan hydrolase  80.99 
 
 
117 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4679  hypothetical protein  39.77 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  38.36 
 
 
340 aa  48.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.56 
 
 
327 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.56 
 
 
330 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.56 
 
 
330 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
374 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.94 
 
 
327 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  35.8 
 
 
318 aa  47.8  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.73 
 
 
319 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  36.96 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  34.29 
 
 
361 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  36.67 
 
 
348 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000732  flagellar protein FlgJ  34.33 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  35.14 
 
 
316 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3062  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.85 
 
 
330 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3363  rod binding protein-like protein  33.33 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0271  lateral flagellar peptidoglycan hydrolase LfgJ  33.33 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.697145 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2927  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.33 
 
 
330 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 
361 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.33 
 
 
332 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.86 
 
 
361 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04917  putative flagellar protein FlgJ  32.84 
 
 
182 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0219  peptidoglycan hydrolase  34.33 
 
 
97 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0647  peptidoglycan hydrolase  34.33 
 
 
97 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1970  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  30.86 
 
 
370 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1466  flagellar biosynthesis  33.78 
 
 
155 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0112  rod binding protein-like protein  35.8 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1962  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  37.31 
 
 
290 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1460  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.43 
 
 
313 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.969398  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4191  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.63 
 
 
327 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1629  mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  34.29 
 
 
294 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.610311 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.84 
 
 
310 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  29.33 
 
 
560 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1943  peptidoglycan hydrolase FlgJ  33.82 
 
 
416 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0130803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>