22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A0245 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A0245  peptidoglycan hydrolase  100 
 
 
117 aa  227  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0192  peptidoglycan hydrolase  83.49 
 
 
121 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.628874  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4679  hypothetical protein  34.69 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 
374 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  38.03 
 
 
318 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3742  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  35.44 
 
 
340 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.412166  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2403  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 
330 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3017  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 
330 aa  43.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.110386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3036  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 
327 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3012  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 
319 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6363  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 
327 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  37.8 
 
 
122 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0647  peptidoglycan hydrolase  34.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0219  peptidoglycan hydrolase  34.33 
 
 
97 aa  42  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000732  flagellar protein FlgJ  32.84 
 
 
182 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  30.99 
 
 
361 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  32.2 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.35 
 
 
332 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  32.95 
 
 
379 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5633  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.84 
 
 
348 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02920  putative flagellar biosynthesis  32.43 
 
 
316 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2956  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.33 
 
 
310 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.4659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>