19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4679 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4679  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141302 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0192  peptidoglycan hydrolase  39.76 
 
 		 121 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.628874  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0245  peptidoglycan hydrolase  34.69 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0271  lateral flagellar peptidoglycan hydrolase LfgJ  34.72 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.697145 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0647  peptidoglycan hydrolase  35.71 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0219  peptidoglycan hydrolase  35.71 
 
 		 97 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3363  rod binding protein-like protein  34.72 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2205  RelA/SpoT protein  29 
 
 		 318 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1485  flagellar protein FlgJ  28.4 
 
 		 379 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.477202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1311  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.85 
 
 		 367 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1110  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.94 
 
 		 328 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.4 
 
 		 430 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.29 
 
 		 394 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.33 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.33 
 
 		 384 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  35 
 
 		 361 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  31.58 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  32.53 
 
 		 135 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>