30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3132 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  228  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  72.82 
 
 
107 aa  163  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  68.37 
 
 
111 aa  147  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  68.69 
 
 
162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  68.32 
 
 
122 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  68.32 
 
 
122 aa  142  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  71.43 
 
 
116 aa  141  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  67.33 
 
 
122 aa  140  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  66.34 
 
 
122 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  63.27 
 
 
105 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  71.43 
 
 
99 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  60.75 
 
 
111 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  62.5 
 
 
105 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  67.74 
 
 
97 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  58.82 
 
 
106 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  63 
 
 
111 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  70.1 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  61.86 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  67.33 
 
 
122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  50.96 
 
 
113 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  66.28 
 
 
88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  51 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  110  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  50 
 
 
118 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  67.11 
 
 
84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  48.04 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  48 
 
 
118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  65 
 
 
82 aa  106  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  62.5 
 
 
82 aa  103  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  70.45 
 
 
47 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>