30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2889 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  100 
 
 		 111 aa  233  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  85.59 
 
 		 111 aa  201  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  62.75 
 
 		 111 aa  144  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  60.75 
 
 		 109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  62.24 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  58.82 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  59.22 
 
 		 107 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  58.16 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  59.22 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  59.22 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  59.8 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  61.54 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  58.42 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  58.82 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  57.84 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  55.34 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  60.22 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  52.48 
 
 		 113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  58.25 
 
 		 122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  59.57 
 
 		 99 aa  113  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  51 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  52.08 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  49 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  50 
 
 		 118 aa  103  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  55.42 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  57.14 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  56.96 
 
 		 84 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  53.25 
 
 		 82 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  60.98 
 
 		 47 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>