30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3361 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  100 
 
 
105 aa  221  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  83.81 
 
 
105 aa  185  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  83.81 
 
 
105 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  62.5 
 
 
111 aa  143  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  65 
 
 
122 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  64 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  69.32 
 
 
97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  64.65 
 
 
116 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  62.63 
 
 
162 aa  130  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  66.02 
 
 
119 aa  130  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  63 
 
 
122 aa  130  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  62 
 
 
122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  67.05 
 
 
99 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  61.86 
 
 
109 aa  125  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  59.41 
 
 
111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  61.76 
 
 
122 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  58.42 
 
 
111 aa  122  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  58.16 
 
 
107 aa  119  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  65.06 
 
 
88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  53 
 
 
106 aa  115  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  64.94 
 
 
82 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  64.94 
 
 
84 aa  110  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  61.04 
 
 
82 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  48.45 
 
 
113 aa  100  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  48.98 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  47.96 
 
 
124 aa  98.2  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  47.96 
 
 
118 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  46.94 
 
 
118 aa  97.4  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  46.94 
 
 
118 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  71.43 
 
 
47 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>