30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4677 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  202  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  91.67 
 
 
122 aa  188  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  88.66 
 
 
162 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  91.67 
 
 
122 aa  184  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  88.66 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  88.66 
 
 
99 aa  179  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  87.63 
 
 
122 aa  178  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  90.62 
 
 
122 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  87.5 
 
 
88 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  91.36 
 
 
82 aa  156  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  93.51 
 
 
84 aa  153  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  86.59 
 
 
82 aa  149  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  82.61 
 
 
119 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  70.65 
 
 
105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  69.57 
 
 
111 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  68.48 
 
 
105 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  67.74 
 
 
107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  67.74 
 
 
109 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  69.32 
 
 
105 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  64.04 
 
 
116 aa  118  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  60.22 
 
 
111 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  56.99 
 
 
111 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  56.67 
 
 
106 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  48.39 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  48.39 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  48.39 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  48.96 
 
 
118 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  48.96 
 
 
118 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  47.31 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  86.96 
 
 
47 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>