30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3445 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  249  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  76.58 
 
 
122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  78.18 
 
 
122 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  76.58 
 
 
122 aa  176  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  75.68 
 
 
122 aa  173  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  75.23 
 
 
162 aa  170  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  82.61 
 
 
97 aa  161  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  71.15 
 
 
111 aa  161  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  80.85 
 
 
99 aa  158  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  69.61 
 
 
107 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  75.45 
 
 
122 aa  150  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  67.35 
 
 
105 aa  146  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  68.37 
 
 
105 aa  143  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  70.1 
 
 
109 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  66.02 
 
 
105 aa  140  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  79.76 
 
 
88 aa  139  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.21005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  65.38 
 
 
116 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  78.57 
 
 
84 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  80.77 
 
 
82 aa  134  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  61.54 
 
 
111 aa  133  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  79.49 
 
 
82 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0385463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  58.65 
 
 
111 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  55.77 
 
 
106 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  51.46 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  51.46 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  50.49 
 
 
124 aa  111  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  50.5 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  49.5 
 
 
118 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  51 
 
 
113 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  83.72 
 
 
47 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>