30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3211 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3211  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  100 
 
 		 84 aa  174  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1405  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  91.67 
 
 		 99 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.112257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3352  hypothetical protein  94.81 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4806  hypothetical protein  96.1 
 
 		 82 aa  157  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2243  YagB/YeeU/YfjZ family protein  92.11 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3412  hypothetical protein  93.51 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4677  hypothetical protein  93.51 
 
 		 97 aa  153  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1060  hypothetical protein  92.21 
 
 		 88 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21005 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1127  hypothetical protein  92.21 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2857  YagB/YeeU/YfjZ family protein  92.21 
 
 		 82 aa  150  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0385463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1653  YagBYeeUYfjZ family protein  90.91 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0993574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4899  hypothetical protein  90.91 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1771  hypothetical protein  68.29 
 
 		 111 aa  120  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00353643  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0476  hypothetical protein  72.37 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3445  hypothetical protein  78.57 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1030  YagBYeeUYfjZ family protein  68.83 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.845421  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0310  putative antitoxin module of toxin-antitoxin system  66.23 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221822  normal  0.0101783 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3132  hypothetical protein  67.11 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0836664  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3361  YagBYeeUYfjZ family protein  64.94 
 
 		 105 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2889  YagBYeeUYfjZ family protein  56.96 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3339  YagBYeeUYfjZ family protein  62.16 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.110104  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1382  YagBYeeUYfjZ family protein  53.16 
 
 		 111 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5035  Aec75  92.86 
 
 		 47 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0747  hypothetical protein  53.33 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3519  hypothetical protein  49.41 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1453  hypothetical protein  48.24 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1257  hypothetical protein  48.1 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1802  hypothetical protein  45.24 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447282  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1774  hypothetical protein  46.75 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.571009  normal  0.437879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1697  hypothetical protein  46.75 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.16974  normal  0.0657649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>